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范文一:真菌分类学 投稿:叶栐树

假丝酵母属分类研究进展

郭成栓

摘要:概述了假丝酵母属的建立和定义的演变以及分类进展,并介绍了在假丝酵母属分类中常用的一些方法。

关键词:假丝酵母;分类

酵母菌的分类发展非常迅速,从1952年的第一本酵母分类专著问世以来,到1984年又酵母分类专著第三版,酵母菌属的数量已由1952年的26属增加到56属,种的数量由160种增加到600种左右。1984年后属、种数量又有所增加。鉴定的常规方法与新技术也都有发展。假丝酵母属(Candida Berkhout)是酵母菌中最大的一个属,现包括200多种,约占目前已知酵母菌总种数的三分之一[1]。由于假丝酵母的经济重要性及其在整个酵母菌中占的比重,对该属的分类研究作为其他各方面研究的基础,一直是一个颇为活跃的领域。研究手段不断改进,分类系统不断更新。假丝酵母属的常规分类主要依赖于形态和生理特征。由于酵母菌主要以单细胞形式存在、可供考察的形态特征很有限,故其种级水平上的分类,主要以对糖类化合物的发酵和对碳、氮源化合物的同化能力。对外源维生素的依赖性和不同温度下的生长能力等生理学特性为依据。然而,这些特征所表现的均是表型性状,难以反映种间的亲缘关系。在常规分类所测试的30—40项生理生化性状中,许多种间往往只存在一两项区别。而研究表明,有些生理生化性状常常是由单个可变基因控制的,因而是不稳定的。所以在常规分类中对只有一两项生理生化性状差异的相似种做出精确鉴定往往是困难的。目前假丝酵母分类除了细胞形态和行为水平的研究外,也发展了细胞水平,蛋白质水平与基因组水平的研究。借助各种技术的适当运用,对假丝酵母的亲缘关系有了更深入的了解。近10多年来该属的定义已经过两次重大修订[2]。下面对该属的分类研究进展及分类方法作一介绍。

1假丝酵母属的建立及其定义的演变

[3] 假丝酵母属是1923年建立的,Yarrow和Meyer把球拟酵母属(Torulopsis

Berlese)与假丝酵母属合二为一,把前者变为后者的异名,对假丝酵母属的定义作了较大的修订,使这样一个本来就不自然的类群更加异源化,在同一属内包括了子囊菌和担子菌两类酵母的无性型。因此随后就有人依靠下述分类技术的进步对假丝酵母属进行了清理工作。

1)用透射电镜对酵母菌细胞壁的超微结构进行观察的结果发现担子菌酵母的细胞壁为多层结构,而子囊菌酵母的细胞壁则为双层结构.担子菌酵母为全壁芽殖型,而子囊菌酵母则为内壁芽殖型。

2)在细胞壁水解产物单糖组成上。子囊菌酵母与担子菌酵母也有明显差异,子囊菌酵母以甘露糖占优势,不含鼠李糖,岩藻糖和木糖;担子菌酵母则可分为两类:一类含有木糖及少量的甘露糖,另一类含有岩藻糖和/或鼠李糖及相当数量的甘露糖。

3)子囊菌酵母与担子菌酵母在细胞壁超微结构及其水解物单糖组成上的差异,与DBB(Diazonium Blue B Salt)颜色反应和尿素酶试验具有很好的对应性,前者均为阴性而后者均为阳性。这样,子囊菌酵母与担子菌酵母就可以通过简单的颜色反应而区别开来。

Weijman等主要根据上述相关性特征对假丝酵母属进行了重新定义,把假丝

酵母属局限于只包含子囊菌酵母无性型的范围内.把原来包括在该属内的属于担子菌酵母无性型的种分别移入经过相应修订的红酵母属(Rhodotorula Harrison)和隐球酵母属(Cryptoccus Kutzing)中,从而使假丝酵母属多少呈现为一个较为自然的分类群。但是,根据目前这一最新定义,假丝酵母属仍存在一定程度的异源性,表现在该属内泛醌(CoQ)系统的不均一性,包括具Q—6至Q—9四种类型的种[4]。 2假丝酵母的组织化学和免役学分类

2.1脂肪酸的组分分析

近二十年来,脂肪酸在微生物分类中的作用越来越得到微生物分类学者的注意。把全细胞脂肪酸用于酵母菌分类主要是八十年代初才开始的,先后有人对假丝酵母属Candida(Gunasekaran & Hughes,1980)等类属酵母菌的脂肪酸作了测定,并根据脂肪酸数据对这些酵母菌分群,提出一些用脂肪酸进行快速鉴定的方法。 史国利等[5]利用脂肪酸对假丝酵母进行了分类,从结果看,根据脂肪酸对菌株的分类结果与表观性状聚类分析的结果类似,这说明脂肪酸分析作为探索酵母菌系统分类关系的辅助方法是可行的。但脂肪酸的差异只是菌株间整体差异的一部分,只对脂肪酸的分析不能完全反映菌株之间的亲绿关系,按照数值分类学的观点,更科学的分析方法应是将包括脂肪酸性状在内的多种在一起进行多元统计分祈,但这在技术上有许多困难,有持进一步研究。

2.2辅酶系统

辅酶Q作为线粒体上电子转移系统的一部分,广泛存在于各类真菌当中。不同种类的真菌都有一特定的辅酶Q,假丝酵母属是一个无性型的形式属,Yamada和Kondo(1972)发现这个属内的辅酶Q系统很不均一,包括Q—6至Q—10五种类型的种,反映出该属为一极端异源化的类群。1988年Weijman等对该属进行了重新界定,移去了CoQ为Q—10的属于担子菌酵母无性型的种,使该属只包括属于子囊菌的无性型酵母菌。但重新界定后的假丝酵母属在整个酵母菌中仍是一个最不自然的属。包括Q-6至Q—9四种辅酶Q类型。由于在有性型酵母菌中,CoQ类型具有属内专一性,因此该数据对于建立有性型一无性型关联及假丝酵母属的重新划分,使其更趋于成为一个自然的分类群,具有重要的参考价值。白逢彦等[4]根据辅酶Q将29种37株的假丝酵母分为Q-6、Q-7、Q-8三组。由于在有性型酵母菌中,辅酶类型具有属内专一性,因此该数据对于建立有性型一无性型关联及假丝酵母属的重新划分,使其更趋于成为一个自然的分类群,具有重要的参考价值。

2.3 免疫学及其它化学分类方法的应用:

Tsuchia等从假丝酵母属的几个种着手开始了血清学方法在酵母菌分类中的应用研究.分别于1965年和!974年对其研究结果作了总结,并提出了一个与传统分类完全不同的分类系统Spencer和Gorin用核磁共振技术对假丝酵母属作了专门的研究。他们的某些研究结果,如指出了用能否产生假菌丝来区分假丝酵母属和球拟酵母属的不可靠性,对该类酵母菌的分类学研究产生了积极的影响。 3假丝酵母属的分子分类

3.1 DNA碱基组成:大量研究表明,假丝酵母属内种的GC含量变化范围在30%一60%之间[6-7],属内差异高达30%,是所有酵母茵属内GC值差异最大的,进一步反映了这个属的异源性。因为从已测定的酵母菌各属内GC含量来看,属内差异多在10%之内[8]。用GC值可将假丝酵母周内的种分为两组:一组的GC值低于50%、伴随着尿素酶反应阴性;另一组的GC值高于50%、尿素酶反应则为阳性。这两组分别为子囊菌酵母和担子菌酵母的无性型。DNA碱基组成的

分类学意义主要是否定性的。若两株酵母菌间的GC值差异超过1.0%一1.5%(浮力密度法)或超过2.0%一2.5%(热变性法),则表明二者不可能为同一种[8-9]。但具有相同或相近似值的菌株却不一定为同一种或具有相近的亲缘关系。

3.2 DNA一DNA (或DNA—RNA)同源性:DNA同源性或相关性能够比DNA碱基组成更精确地反映菌株间DNA碱基序列的相似程度,因此比后者具有更大的分类学价值,尤其适用于GC值相近的菌种间的分类。Price等[9]根据他们的研究结果建议DNA同源性在80%以上的菌株应视为同一种。但DNA同源率在 60%一80%之间的菌株亦常在以后的研究中遇到。因此目前酵母菌分类学者一般认为,DNA同源率在80%以上的菌株可以确认为属于同一种,在65%一80%之间的代表同一种内分化较远的菌株,在20%以下则被视为代表不同的种。

3.rRNA/rDNA序列分析:核糖体RNA(rRNA)或其模板核糖体DNA(rDNA)的序列分析正被广泛地运用于酵母茵的系统学研究中。Barans等[]Hendricks等Ohkuma等分析了部分假丝酵母苗的小亚基侧rRNA/rDNA序列并据此构建了系统树。Suzuki等测定了20种细胞水解液中含半乳糖的假丝酵母茵的小亚基侧基因序列,并与该属内部分不含半乳糖的种进行了比较分析.结果发现这两组菌在系统树上形成了两个独立的分枝,表明酵母细胞水解液中单糖组成可以反映亲缘关系。

Kuryzman和Robnett[]分析了假丝酵母属内所有已知种的大亚基rRNA基因(LSUrDNA)5’端的部分碱基序列(约600bP),并具此研究了该属内种间亲缘关系.结果表明这一区域具有足够的多变性、从而可以将假丝酵母属内的所有种清楚地区分开,但种内差异却不超过2个bp。而且这一区域内种间序列差异与DNA同源性具有很好的对应性。因此他们认为该段序列可以作为假丝酵母菌种间鉴别的可靠依据。

白逢彦等[11]对根据常规形态和生理生化性状难以确定分类学地位的8株假丝酵母菌,进行了以大亚基(26s)rDNA中D1/D2区域(约500—600bp)的碱基序列分析为依据的分子分类学研究。根据系统树上所显示的供试菌株与假红酵母属及相关子囊菌酵母己知种的亲缘关系,以及与最近缘种模式菌株D1/D2区域序列的相似性比较,确定了各个菌株的归属。本研究也显示了DNA序列分析在假丝酵母菌快速鉴定中的优越性。

3.4 脉冲电泳核型分析:利用一个新发展起来的电泳技术,即脉冲电场凝胶电泳(pulsed field gel electrophosis).简称PEGE技术,可以在琼脂糖凝胶中分离 完整的酵母染色体DNA分子、从而估测酵母细胞染色体条数及其大小。这一被称为脉冲电泳核型分析或分子核型分析的技术已被越来越多地应用于酵母菌的分类学研究中[]。在假丝酵母属的分类中也已经做了许多成功的研究工作

Iwaguchi等和Doi等分析了C.alcibans等8种临床常见病原假丝酵母菌的电泳核型,并估算出了每个种的平均染色体条数及整个基因组大小.各个种内不同菌株间存在染色体条数及大小的变化,但其变化幅度远小于种间差异,每种都具有独自的种内特异性核型。Lee等[]在用CHEF脉冲电泳系统比较分析一些假丝酵母菌模式菌株的电泳核型时发现具有相似或相同核型的种间也具有很高的DNA同源性.白逢严[12]分析了克鲁斯假丝酵母(C.lausci),郎比可假丝酵母

(C.lambica)和粗状假丝酵母(C.valida)的模式菌株的电泳核型,发现这三种表型性状相似的假丝酵母菌却具有互不相同的染色体DNA分子带型,为其分类学研究提供了更可靠的鉴别依据。白逢彦[]用脉冲电泳核型分析结合DNA碱基组成研究证明季也蒙假丝酵母(C.guillermondii)为一异源性的种,其异名Torula ferenmti

Saito代表一个完全不同的种,因此作者以后者为基源异名建立了一个新组合:发酵假丝酵母Torula ferenmti( Saito)Bai comb.nov

3.5 多聚曲链反应(PCR)及其它技术的应用:Iehmann等和Williams等应用随机扩增DNA片段(random amplified polymorphic DNA,RAPD)的多态性以及PCR产物的限制性内切酶切片段多态性等方法探讨了临床常见假丝酵母种间或菌株间基因型上的区别及其快速签定.Millan等用同功酶电泳图谱结合RAPD方法也发现C.guillermondii为一异源性的种,并C.guillermondii和C.ferenmti之间的区分提供了更多更简便的鉴别特征和方法。

4假丝酵母属的数值分类

数值分类是随计算机科学的发展而兴起的,是分类学由定性向定量发展的一个进步,是对传统分类学的补充和完善。,随后在假丝酵母属中也先后引入了数值分类。对假丝酵母的聚类分析和代谢活性的研究表明:某些传统鉴定方法中的鉴定指标不能代表类群的特征,而另外一些指标似乎更具有类群的特征性[13]。 4 结语

分子分类学原理与方法在假丝酵母属分类学研究中日益广泛的应用,在很大程度上改变了以前关于属,种等的分类学概念。许多用常规方法建立起来的种,需要用分子分类学方法来证实。分子分类学方法已成为酵母菌分类学研究中不可或缺的手段。但是,常规方法仍是不可替代的基础。任何新技术与方法的应用,依然并且继续要以传统分类方法为依托,并向多种方法相结合方向发展。

参考文献

[1] Krger-van Rij N J W ed. The yeasts,Taxonomic Study .Amsterdam Elsevier Science Publishers B.V.1984.

[2]Yarrow D ,Meyer S A. Int J Syst Bact ,1978 28 :611-615.

[3]Berhout C M De Schimmelgcslachten Monolia,Oidium,Oospora en torula.Thesis,Utrecht,1923.

[4]白逢彦等,酵母菌辅酶Q提取方法的改进及在假丝酵母属分类学研究中的应用.菌物系统,19(2):217-222,2000.

[5]史国利等,全细胞长链脂肪酸在假丝酵母属分类中的鱼应用初探.真菌学报,11(2):150-157,1992.

[6]Nakase T Komagata K J Gen Appl Microbiol,1971a,17:161-166

[7] Nakase T Komagata K J Gen Appl Microbiol,1971b,17:161-166

[8]Kurtzman C P ,Phaff H J.In Rose A H,Harrison J S eds.The Yeast ,VoL.I,Biology of Yeasts.London,Acamedic Press.1987,63-94.

[9]Price C W,fuson G B,Phaff H J.Microbiol Rev,1978,42:161-193.

[10]Tsuchia T,Fukazawa Y,Taguwi

[11]白逢彦等,假丝酵母属疑难菌株大亚基rDNADl/D2区域序列分析及其分类学意义,菌物系统.21(1):27 -32,2002 .

[12]白逢彦等,克鲁斯假丝酵母及其近似种的脉冲电泳核型分析,微生物学报.36

(5):329-334,1996.

[13]Muller GM Mycologia,1985,77(1):121-129.

范文二:真菌分类表 投稿:武礕礖

真菌分类表

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(重定向自真菌分類表)

真菌分类表,本列表使用NCBI所公告之真菌分類表[1]為準。

以前的分類學家將真菌和细菌都列為植物,称为菌类植物,但他们和植物相当不同,都是异养生物,现在的分类法倾向将它们独立在动物和植物之外,各自单独分为一个界。

目录

[隐藏]

 o  1.1.1 粒毛盘菌纲 (Neolectomycetes)    o  1.2.1 星裂菌纲 (Arthoniomycetes)      1.2.6 茶渍纲 (Lecanoromycetes)      1.2.8 李基那地衣纲 (Lichinomycetes)      1.2.11.2 粪壳菌亚纲 (Sordariomycetidae)  o 1.3 酵母菌亚门 (Saccharomycotina)  o 2.1 异担子菌纲 (Heterobasidiomycetes)   2.1.2 银耳亚纲 (Tremellomycetidae) o 2.2 同担子菌纲 (Homobasidiomycetes) o  2.3.1 亚纲 (Agaricostilbomycetidae)   2.3.3 锈菌亚纲 (Urediniomycetidae) o 2.4 黑粉菌纲 (Ustilaginomycetes)   2.4.2 外担子菌亚纲 (Exobasidiomycetidae)  3 壶菌门 (Chytridiomycota) o

5.1 毛菌纲 (Trichomycetes)

o

 o

[编辑] 子囊菌门 (Ascomycota)

[编辑] 外囊菌亚门 (Taphrinomycotina)

[编辑] 粒毛盘菌纲 (Neolectomycetes)

 粒毛盘菌目 (Neolectales)

o 粒毛盘菌科 (Neolectaceae)

[编辑] 肺孢子菌纲 (Pneumocystidomycetes)

 (Pneumocystidales)

o 肺孢子菌科 (Pneumocystidaceae)

[编辑] 裂殖酵母纲 (Schizosaccharomycetes)

 (Schizosaccharomycetales)

o (Schizosaccharomycetaceae)

[编辑] 外囊菌纲 (Taphrinomycetes)

 (Protomycetales)

 外囊菌目 (Taphrinales)

 (Coryneliales)

 (Medeolariales)

 (Mycocaliciales)

 (Pyrenulales)

[编辑] 盘菌亚门 (Pezizomycotina)

[编辑] 星裂菌纲 (Arthoniomycetes)

 (Arthoniales)

[编辑] 刺盾炱纲 (Chaetothyriomycetes)

 刺盾炱目 (Chaetothyriales)

 (Verrucariales)

[编辑] 座囊菌纲 (Dothideomycetes)

 (Capnodiales)

 (Dothideales)

 (Hysteriales)

(Mytilinidiaceae)

 假黑粉霉属 (Sirodesmium)

 (Jahnulales)

 (Myriangiales)

 (Patellariales)

 (Pleosporales) o [编辑] 散囊菌綱 (Eurotiomycetes)

 (Arachnomycetales)

 (Eurotiales)

 (Onygenales)

[编辑] 虫囊菌綱 (Laboulbeniomycetes)

 虫囊菌目 (Laboulbeniales)

[编辑] 茶渍纲 (Lecanoromycetes)

[编辑] 微孢衣亚纲 (Acarosporomycetidae)

 (Acarosporales)

[编辑] 茶渍亚纲 (Lecanoromycetidae)

 (Lecanorales)

 (Peltigerales)

[编辑] 厚顶盘菌亚纲 (Ostropomycetidae)

 (Agyriales)

 (Gyalectales)

 (Ostropales)

 (Pertusariales)

 (Trichotheliales)

[编辑] 锤舌菌纲 (Leotiomycetes)

 (Helotiales)

柔膜菌科 (Helotiaceae)

o 火絲菌科 (Pyronemataceae) o

o 核盤菌科 (Sclerotiniaceae)

[编辑] 李基那地衣纲 (Lichinomycetes)

 (Lichinales)

[编辑] 圆盘菌纲 (Orbiliomycetes)

 (Orbiliales)

[编辑] 盘菌纲 (Pezizomycetes)

 (Pezizales)

o o o o o o o o o o o (Helvellaceae) 羊肚菌科 (Morchellaceae) - 羊肚菌 (Sarcosomataceae) 肉杯菌科 (Sarcoscyphaceae) 块菌科 (Tuberaceae) (Otideaceae) 盤菌科 (Pezizaceae) (Ascobolaceae) 平盘菌科 (Discinaceae) 火丝菌科 (Pyronemataceae) (Terfeziaceae)

[编辑] 粪壳菌纲 (Sordariomycetes)

 (Calosphaeriales)

 路霉目 (Lulworthiales)

 (Meliolales)

 (Phyllachorales)

 (Trichosphaeriales)

[编辑] 肉座菌亚纲 (Hypocreomycetidae)

 (Coronophorales)

 (Halosphaeriales)

 肉座菌目 (Hypocreales)

麥角菌科(Clavicipitaceae)- 冬虫夏草

 (Microascales) o [编辑] 粪壳菌亚纲 (Sordariomycetidae)

 (Boliniales)

 (Chaetosphaeriales)

目 (Coniochaetales)

 (Diaporthales)

 (Ophiostomatales)

 (Sordariales)

 (Spathulosporales)

[编辑] 炭角菌亚纲 (Xylariomycetidae)

 (Xylariales)

o (Xylariaceae)

[编辑] 酵母菌亚门 (Saccharomycotina)

[编辑] 酵母纲 (Saccharomycetes)

 (Saccharomycetales)

o (Saccharomycetaceae)

 酵母屬(Saccharomyces) - 酵母 - 釀酒酵母

[编辑] 担子菌门 (Basidiomycota)

[编辑] 异担子菌纲 (Heterobasidiomycetes)

[编辑] 异担子菌亚纲 (Heterobasidiomycetidae)

 (Auriculariales)

(Auriculariaceae)

 木耳屬(Auricularia)

 (Auricularia auricula-judae)

 (Auricularia delicata)

 褐黄木耳(Auricularia fuscosuccinea)

 (Auricularia mesenterica)

 毛木耳(Auricularia polytricha)

 (Auricularia eburnea)

o (Exidiaceae)

o 明目耳科(Hyaloriaceae)

 (Dacrymycetales)

o 科(Cerinomycetaceae)

o 花耳科(Dacrymycetaceae)

 (Sebacinales)

o 蜡壳耳科(Sebacinaceae) o [编辑] 银耳亚纲 (Tremellomycetidae)

目 (Christianseniales)

科 (Christianseniaceae)

 (Cystofilobasidiales)

o 科 (Cystofilobasidiaceae)

 (Filobasidiales)

o 线黑粉菌科(Filobasidiaceae)

 (Tremellales)

o (Aporpiaceae)

o 链担耳科(Sirobasidiaceae)

o (Tremellaceae)

 丝孢酵母目 (Trichosporonales) o

[编辑] 同担子菌纲 (Homobasidiomycetes)

 (Agaricales)

o o o o o o o o o o o o o o o o o o (Agaricaceae ) 鵝膏菌科(Amanitaceae) 粪锈伞科(Bolbitiaceae) (Boletaceae) 鬼傘科(Coprinaceae) (Cortinariaceae) 靴耳科(Crepidotaceae) 粉褶菌科(Entolomataceae) (Gomphidiaceae) 蠟傘科(Hygrophoraceae) (Lepiotaceae) 网褶菌科(Paxillaceae) 側耳科(Pleurotaceae) (Pluteaceae) 红菇科(Russulaceae) (Schizophyllaceae) 球盖菇科(Strophariaceae) 口蘑科(Tricholomataceae)- 香菇 (Lentinus Edodes)

 (Aphyllophorales)

o o o o o o (Albatrellaceae) 科(Atheliaceae) 耳匙菌科(Auriscalpiaceae) (Bondarzewiaceae) 绒柄革菌科(Boreostereaceae) (Coriolaceae)

o o o o o o o o o o o o o o o o o o o o o o o o 伏革菌科(Corticiaceae) 科(Cystostereaceae) (Dictyonemataceae) 科(Epitheliaceae) (Fistulinaceae) 白肉迷孔菌科(Fomitopsidaceae) 靈芝科(Ganodermataceae) (Gloeophyllaceae) 科(Grammotheleaceae) (Hapalopilaceae) 丝毛伏革菌科(Hyphodermataceae) 茸瑚菌科(Lachnocladiaceae) (Lentinaceae) 薄孔菌科(Meripilaceae) (Meruliaceae) 科(Phanerochaetaceae) 柄杯菌科(Podoscyphaceae) (Polyporaceae) 科(Pterulaceae) (Schizophyllaceae) 科(Sistotremataceae) 齿耳菌科(Steccherinaceae) (Tubulicrinaceae) 科(Xenasmataceae)

 (Boletales)

o o o o o o o o o 牛肝菌科(Boletaceae) 硬馬勃科(Sclerodermataceae) (Rhizopogonaceae) 粉孢革菌科(Coniophoraceae) (Diplocystaceae) 腹孢菌科(Gastrosporiaceae) 拟蜡伞科(Hygrophoropsidaceae) (Leucogastraceae) 干腐菌科(Serpulaceae)

 (Cantharellales)

o 雞油菌科(Cantharellaceae)

 (Ceratobasidiales)

 (Gautieriales)

 (Geastrales)

o (Geastraceae)

 (Hericiales)

 刺革菌目 (Hymenochaetales)

o 刺革菌科(Hymenochaetaceae)

 (Hymenogastrales)

 (Lycoperdales)

o (Lycoperdaceae)

 (Nidulariales)

鳥巢菌科(Nidulariaceae)

o (Sphaerobolaceae)

 (Phallales)

o 籠頭菌科(Clathraceae)

o 鬼筆科(Phallaceae)

 (Stereales)

 (Thelephorales)

o 革菌科(Thelephoraceae) o  (Tulasnellales)

 柄灰包目 (Tulostomatales)

[编辑] 锈菌纲 (Urediniomycetes)

[编辑] 亚纲 (Agaricostilbomycetidae)

 (Agaricostilbales)

[编辑] 微球黑粉菌亚纲 (Microbotryomycetidae)

 (Cryptomycocolacales)

 (Heterogastridiales)

 (Leucosporidiales)

 (Microbotryales)

 锁掷酵母目 (Sporidiobolales)

[编辑] 锈菌亚纲 (Urediniomycetidae)

 (Classiculales)

 (Cystobasidiales)

 (Platygloeales)

 隔担子菌目 (Septobasidiales)

 (Uredinales)

[编辑] 黑粉菌纲 (Ustilaginomycetes)

[编辑] 亚纲 (Entorrhizomycetidae)

 (Entorrhizales)

[编辑] 外担子菌亚纲 (Exobasidiomycetidae)

 (Doassansiales)

 (Entylomatales)

 外担子菌目 (Exobasidiales)

 (Georgefischeriales)

 (Malasseziales)

 (Microstromatales)

 (Tilletiales)

[编辑] 黑粉菌亚纲 (Ustilaginomycetidae)

 (Urocystales)

 (Ustilaginales)

[编辑] 壶菌门 (Chytridiomycota)

 (Blastocladiales)

 (Chytridiales)

 (Monoblepharidales)

 (Neocallimastigales)

 (Spizellomycetales)

[编辑] 球囊菌门 (Glomeromycota)

[编辑] 球囊菌纲 (Glomeromycetes)

 (Archaeosporales)

 多孢囊霉目 (Diversisporales)

 (Glomerales)

 (Paraglomerales)

[编辑] 接合菌门 (Zygomycota)

[编辑] 毛菌纲 (Trichomycetes)

 (Harpellales)

钩孢毛菌科(Harpellaceae) o 科(Legeriomycetaceae) o [编辑] 接合菌纲 (Zygomycetes)

 (Dimargaritales)

双珠霉科(Dimargaritaceae)  (Endogonales)

o 内囊霉科(Endogonaceae)  (Entomophthorales)

o 新月霉科(Ancylistaceae) o 担子霉科(Basidiobolaceae) o 虫霉科(Entomophthoraceae) o 科(Neozygitaceae)  (Kickxellales)

o 梳霉科(Kickxellaceae)  (Mortierellales)

o 被孢霉科(Mortierellaceae)  (Mucorales)

o (Chaetocladiaceae) o 笄霉科(Choanephoraceae) o 小克银汉霉科(Cunninghamellaceae) o 吉尔霉科(Gilbertellaceae) o 毛霉科(Mucoraceae) o (Mycotyphaceae) o 水玉霉科(Pilobolaceae) o (Radiomycetaceae) o 瓶霉科(Saksenaeaceae) o 共头霉科(Syncephalastraceae) o (Thamnidiaceae)  (Zoopagales)

o (Helicocephalidaceae) o 头珠霉科(Piptocephalidaceae) o 科(Sigmoideomycetaceae) o (Zoopagaceae) o

范文三:真菌分类表 投稿:许哝哞

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o 1.1 外囊菌亚门 subphylum(Taphrinomycotina)

 

 1.1.1 粒毛盘菌纲 (Neolectomycetes) 1.1.3 裂殖酵母纲 (Schizosaccharomycetes) o 1.2 盘菌亚门 (Pezizomycotina) 1.2.1 星裂菌纲 (Arthoniomycetes) 1.2.3 座囊菌纲 (Dothideomycetes) 1.2.4 散囊菌纲 (Eurotiomycetes) 1.2.6 茶渍纲 (Lecanoromycetes)   1.2.6.2 茶渍亚纲 (Lecanoromycetidae)  1.2.6.3 厚顶盘菌亚纲 (Ostropomycetidae) 1.2.8 李基那地衣纲 (Lichinomycetes) 1.2.9 圆盘菌纲 (Orbiliomycetes) 1.2.11 粪壳菌纲 (Sordariomycetes) 

      1.2.11.3 炭角菌亚纲 (Xylariomycetidae) o 1.3 酵母菌亚门 (Saccharomycotina)  1.3.1 酵母纲 (Saccharomycetes) 

o 2.1 异担子菌纲 (Heterobasidiomycetes) 

 2.1.1 异担子菌亚纲 (Heterobasidiomycetidae) o 2.2 同担子菌纲 (Homobasidiomycetes)

o 2.3 锈菌纲 (Urediniomycetes)

1

 2.3.2 微球黑粉菌亚纲 (Microbotryomycetidae) o 2.4 黑粉菌纲 (Ustilaginomycetes)

  

 2.4.3 黑粉菌亚纲 (Ustilaginomycetidae) o 4.1 球囊菌纲 (Glomeromycetes)

o 5.1 毛菌纲 (Trichomycetes) o 

子囊菌门 (Ascomycota)

外囊菌亚门 (

Taphrinomycotina)

粒毛盘菌纲 (Neolectomycetes)

(Pneumocystidomycetes)

裂殖酵母纲 (Schizosaccharomycetes)

2

(Chaetothyriomycetes)

座囊菌纲 (Dothideomycetes)

3

(Laboulbeniomycetes)

(Lecanoromycetes)

(Acarosporomycetidae)

4

炭角菌亚纲 (Xylariomycetidae)

5

(Saccharomycotina)

(Saccharomycetes)

(Basidiomycota)

(Heterobasidiomycetes)

(Heterobasidiomycetidae)

6

(Homobasidiomycetes)

7

8

(Urediniomycetes)

(Agaricostilbomycetidae)

(Microbotryomycetidae)

9

(Urediniomycetidae)

黑粉菌纲 (Ustilaginomycetes)

亚纲 (Entorrhizomycetidae)

外担子菌亚纲 (Exobasidiomycetidae)

(Ustilaginomycetidae)

壶菌门 (Chytridiomycota)

10

(Glomeromycota)

(Glomeromycetes)

接合菌门

(Zygomycota)

毛菌纲 (Trichomycetes)

接合菌纲 (Zygomycetes)

参考文献

List of fungal orders

Contents

o

o 1.2 Class Pneumocystidomycetes

o

o

o 1.5 Subphylum Pezizomycotina

       1.5.8 Class Lichinomycetes       o  o 2.1 Class Heterobasidiomycetes   o 2.2 Class Homobasidiomycetes o   2.3.2 Subclass Microbotryomycetidae  o 2.4 Class Ustilaginomycetes    o 4.1 Class Glomeromycetes

o 5.1 Class Trichomycetes

o

Phylum Ascomycota

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Class Neolectomycetes

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Class Pneumocystidomycetes

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 Order Pneumocystidales

Class Schizosaccharomycetes

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 Order Schizosaccharomycetales

Class Taphrinomycetes

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 Order Mycocaliciales

Subphylum Pezizomycotina

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Class Arthoniomycetes

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 Order Arthoniales

Class Chaetothyriomycetes

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 Order Chaetothyriales

Class Dothideomycetes

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 Order Capnodiales

 Order Hysteriales

 Order Patellariales

Class Eurotiomycetes

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 Order Eurotiales

Class Laboulbeniomycetes

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Class Lecanoromycetes

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Subclass Acarosporomycetidae

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 Order Acarosporales

Subclass Lecanoromycetidae

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 Order Lecanorales

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 Order Agyriales

 Order Ostropales

Class Leotiomycetes

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Class Lichinomycetes

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Class Orbiliomycetes

This section lists the orders of Fungi within the class Orbiliomycetes.

Class Pezizomycetes

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Class Sordariomycetes

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 Order Calosphaeriales

 Order Phyllachorales

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 Order Coronophorales

 Order Hypocreales

Subclass Sordariomycetidae

This section lists the orders of Fungi within the subclass Sordariomycetidae.

 Order Ophiostomatales

Subclass Xylariomycetidae

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 Order Xylariales

Subphylum Saccharomycotina

This section lists the orders of Fungi within the subphylum Saccharomycotina.

Class Saccharomycetes

This section lists the orders of Fungi within the class Saccharomycetes.

Phylum Basidiomycota

This section lists the orders of Fungi within the phylum Basidiomycota.

Class Heterobasidiomycetes

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Subclass Heterobasidiomycetidae

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 Order Dacrymycetales

Subclass Tremellomycetidae

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 Order Cystofilobasidiales

Class Homobasidiomycetes

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 Order Boletales

 Order Ceratobasidiales

 Order Hericiales

 Order Hymenogastrales

 Order Phallales

 Order Tulasnellales

Class Urediniomycetes

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 Order Atractiellales

Subclass Agaricostilbomycetidae

This section lists the orders of Fungi within the subclass Agaricostilbomycetidae.

Subclass Microbotryomycetidae

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 Order Heterogastridiales

Subclass Urediniomycetidae

This section lists the orders of Fungi within the subclass Urediniomycetidae.

 Order Platygloeales

 Order Uredinales

Class Ustilaginomycetes

This section lists the orders of Fungi within the class Ustilaginomycetes.

Subclass Entorrhizomycetidae

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 Order Entorrhizales

Subclass Exobasidiomycetidae

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 Order Entylomatales

 Order Georgefischeriales

 Order Tilletiales

Subclass Ustilaginomycetidae

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Phylum Chytridiomycota

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 Order Blastocladiales

 Order Neocallimastigales

Phylum Glomeromycota

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Class Glomeromycetes

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 Order Diversisporales

Phylum Zygomycota

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Class Trichomycetes

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Class Zygomycetes

This section lists the orders of Fungi within the class Zygomycetes.

 Order Mortierellales

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22

范文四:DNA真菌分类 投稿:金懥懦

第6卷第l期

Vol.6No.l

华南热带农业大学学报

JOURNALOFSOUTHCHINAUNIVERSITYOFTROPICALAGRICULTURE

2000年3月

Mar.2000

应用!

谢艺贤

郑服丛

海南儋州

57l737)

(中国热带农业科学院植物保护研究所

摘要系统介绍现代分子生物技术RFLPS,PCR,RAPDS,ALFPS和SAPS技术在真菌分类上的价DNA分子

真菌分类

原理和方法

值以及在某些方面已取得的成就,并详细介绍其分类原理和操作方法。关键词

真菌的亲缘关系或系统性的研究是建立生物资源预期价值信息存取系统不可缺少的内容。真菌分类学也是进行真菌遗传学、种群学以及流行病学研究的基础。近两个世纪以来,真菌分类一直是以形态学为性征(或交配型);(2)主,主要分类依据:(l)性器官的形态,包括性器官的大小、形状、壁的厚度;(3)无性世代的形态,包括分生孢子的形态、孢子梗的长度、乳突、菌丝的肿大体致病性,不同的种类侵染的对象和部等;(4)位不一样,侵染方式不同。

近几年来,随着生理生化特性遗传变异特点、血清学反应、酶学、分子生物学技术以及计算机技术等新的分类依据不断地被引入微生物学分类当中,真菌分类技术又增添血清了新的内容,分类依据也有所扩充:(l)学。血清学的方法已被广泛应用于真菌的

[l]

。其中,免疫荧光法是近几十年来发研究

质凝胶电泳。蛋白质电泳对解决疑难种的鉴定、异名的处理等分类学问题是较为简单易行的方法,在解决什么是种内形态变异和什么是种间性状交叉问题时成为一个很重

[2]

。(3)同功酶。同功酶作为一类要的依据

蛋白质,其结构是由基因决定的。同功酶结构反映了生物间的亲缘关系,因此酶谱分析

[3]

。随着分子生可应用于种和种下的分类

物学的发展,新的分子生物学技术的应用更新了系统学的研究。核酸分析可用来区分物种和评价亲缘系统发生的关系。DNA作为遗传物质要比表型特征更为真实地反应真菌的系统发育。

核酸分析是在真菌学的系统发育和群体研究方面迅速发展起来的新技术。核酸已经成为细菌分类学有的碱基组成(GC值)价值的工具,并已列为分类群的属性。真菌的GC值有一个与细菌相似的范围。从GC值来看,真菌的进化是由GC值递增表现出

[4]

来的。另外DNA的含量也存在差异。

展起来的一门较先进的技术,它具有免疫学特异性和敏感性,又能在显微镜下清晰地看到染色体对象的形体特征,从而显著地提高菌丝可溶性蛋白了结果判断的可靠性。(2)

用分子杂交的方法可以找到DNA的同源序列。两种生物之间的亲缘关系越近,它

36华南热带农业大学学报

述。1

第6卷

们之间所共有的多核苷酸的相同序列就越多,即同源百分率越高。DNA同源序列用于区分一般形态学方法不易鉴定的真菌种类是有价值的。不但能区分不同的种类,还

[5]

。DNA-可以进一步找出其亲缘关系

RFLPs-(restrictionfragmentlength研究是在种、种内以及多态性(RFLP)

polymorphisms)DNA的限制性片段长度

[6]

种群水平上进行分类研究的有效手段。

RNA杂交的研究与DNA-DNA重组相比较,给基因组中已知类群RNA的顺反子计算提供了可能,这样的研究也为分类学和系

[4]

。统发育的分析提供了一个很好的工具

其基本原理是不同种、种内以及种群的造成限DNA序列在进化过程中发生突变,制性切点间的插入缺失重排或点突变。因此,当用某一限制性内切酶消化DNA时将产生不同长度的DNA片段。但由于通过电泳无法直接观察到结果,因此需寻找一个合适的探针(用同位素标记,或生物素、地高辛标记)来进行杂交,然后才可以观察到结果。其基本操作方法见图l:

生物的遗传与变异推动了生物的进化。作为遗传物质的DNA的序列直接决定了生物的种类。因此,用DNA分子对真菌进行分类能更准确更直接地反映真菌的系统发育。目前常用的DNA分子进行真菌分类的方法有:RFLP、PCR、RAPD、AFLP、SAP等几种方法。下面就对其原理和方法作简要阐

样品提取基因组DNA用限制性酶酶解琼脂糖凝胶电泳DNA变性

放射自显影#洗膜#杂交#预杂交#将DNA转移到固相支撑物

$

用32P标记DNA探针

图1

RFLP分析流程图

[7]

。PCR的出现为究中得到部分应用

通过借助计算机处理大量的数据材料可以对DNA样品进行有效的分析,从而对样品的分类提供直接的依据。2

PCR和RAPDs-(polymerasechain多聚酶链式反应(PCR)的出现为真菌DNA的扩增提供了更为方便和准确的方法。通过PCR扩增具有种间特异性的DNA片段从而决定种间的不同,已在真菌分类研

同时PCR扩增产mRNA的研究提供了方便,

物的限制性分析RAPDS免去了Southern印迹或放射自显影的麻烦。

RAPDS-随机引物扩增多态性DNA。这种方法是建立在PCR基础之上的又一新的技术,这一技术为真菌分类提供了新的快速的方法。该方法适用于种以下水平的分类学研究并在真菌分类中已得到了部分应

[8]

用。Bichard等用RAPD鉴定了禾顶囊壳

reaction,randomamplifiedpolymorplisms)

第1期谢艺贤等:应用DNA分子进行真菌分类的原理及方法37

(Gaeumannomycesgraminis)的亚种,发现欧洲亚种同北美亚种具有相同的遗传图谱,从而证实了北美亚种是由欧洲引入北美大陆的。

[9]

使用该技术很容易地把A.JOHANSON等

香蕉上的Mycosphaereiia近似种区分开来。RAPD也可用于依靠形态分类类群间的遗

[10]

传亲和性研究。其基本原理见图2

图2PCR扩增反应流程图

如图2所示,随机引物可以同DNA分子上不同的地方配对(随机引物为10p),通过PCR反应后可以直接电泳后看到结果。由于不同的样品DNA与引物(primer)结合

待分析样品DNA的提取随机引物PCR扩增

的位点不同,其扩增产物也不同,因此可根据其扩增产物的差异来对真菌进行分类。其基本操作方法如下:

PCR反应条件



94C1min36C1min72C2min35~45Cycies

扩增产物电泳分析

这一方法具有用量少、鉴定迅速、可重复性等特点。3

AFLPs(amplifiedfregmentlength此方法是结合限制性片段长度多态性(RFLP)和随机引物扩增多态性DNA

(RAPD)两项技术而形成的另一新的更有效的DNA指纹图谱的技术。此技术是1993年由荷兰Kcygene公司科学家ZabeauMarc和VosPieter发明创建的一种DNA分子标记新技术,它的特点是多态性丰富,共显性表达,不受环境影响,无复等位效应,而且还具有带纹丰富,用样量少,灵敏度高,快速高

[11]

扩增片段长度多态性polymorphisms)

38华南热带农业大学学报第6卷

效等特殊优点。目前,不仅在小麦、水稻、玉米、大豆和棉花等主要农作物上得以应用,而且在蔬菜(番茄、马铃薯)、林木[垂枝桦(Betulapendula)、辐射松(Pinulradiata)]以及植物基因组研究的模式植物拟南芥上广

[l2]泛应用。

制性内切酶双酶切后,形成分子量大小不等的随机限制性片段,将特定的接头(adapter)连接在这些DNA片段的两端,形成一个带接头的特异片段,通过接头序列和PCR引特异性片段经变性,退火物3'末端的识别,

延伸周期性循环而扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分子筛的作用,将这些特异的限制性片段分离开来(图3)

其基本原理是基于对植物基因组总DNA双酶切经PCR扩增后的限制性片段进

[ll]行克隆。具体是植物基因组DNA经限

图3AFLP操作原理

[l3]

骤。各步骤具体的过程有:(l)提取样品

其操作流程包括模板准备(DNA的提取)、片段扩增和凝胶分析三个主要步

针对植物基因DNA经浓度和质量检测后,

第1期谢艺贤等:应用DNA分子进行真菌分类的原理及方法

前还很少在真菌分类上应用。4

SAP

技术(Specific

39

组富含AT的特点选择6个碱基识别位点的限制性内切酶,通常是EOORI或PSII或SSeI,和4个碱基识别位点的限制性内切酶,通常是MSeI或SSeI在适宜的缓冲系统中进行酶酶切后的限制性片段在T4连接酶切。(2)的作用下与特定的接头相连接,形成带有接头的特异性片段。(3)利用磁珠(粉)在选择带有STEX盐溶液中反复洗脱2~3次,

特定接头的限制性片段。(4)PCR前扩增。(5)利用同位素标定PCR引物。(6)在完成94C变性TagDNA聚合酶的作用下,

30S—65C退火30S—72C延伸60SPCR扩增36个循环。(7)PCR产物变性后在含尿素的聚丙烯酰胺变性胶上电泳。(8)将电泳后的凝胶转移吸到滤纸上,经干胶仪进行干胶处理。(9)在X光片上感光,数日后洗胶并进行结果分析。这一技术将更直接真实,更全面地反映基因组DNA的情况,更有利于提高真菌分类的准确性。但这一技术目

Amplified

专一引物扩增Polymorphisim)

这一技术的基本原理:生物在进化过程中,DNA的进化往往涉及到内含子的插入,不同的品种其插入的内含子序列和大小不同,而其两侧的DNA序列往往变化很少———保守区。因此,根据其两侧保守区序列设计引物,经PCR可以扩增出内含子片段,然后经过比较其大小和序列可以对生物进行分类,从而推测其进化关系和亲缘关系。

其基本操作方法:(l)样品DNA的提取。(2)根据已知序列设计引物。(3)PCR反应及PCR扩增产物电泳分析。(4)PCR产物酶切电泳分析。(5)扩增产物序列分析(见图4)。根据分析的结果可以弄清某一

真菌的进化关系和亲缘关系。

图4SAP技术原理及流程图

40华南热带农业大学学报第6卷

随着生物技术的发展,将有越来越多的新的技术应用到真菌分类上,鉴定形态上难于区分的种,研究真菌的亲缘关系以及真菌的遗传、变异、分布等,真菌的分类将渐渐走7

(2):1992,84139~153

TayIorJW.PoIymerasechainreactionGargasA,

(PCR)primersforampIifyingandseguencingnucIear18SrDNAfromIichenizedfungi.MycoIogia,向分子水平,并正走向多学科的综合。

参考文献

1HamamotoM,SugiyamaF,KomagataK.JGenAppIMicroboI,1997,32:215~223

2

马国忠,余永年.凝胶电泳与腐霉属的分类.真菌学报,1991,10(3):217~222

3

HansonLC,CharacterizationofthreeTremeIIaspeciesbyisozymeanaIysis.MycoIogia,1991,83:446~454

4周与良,

邢来君.真菌的系统发育和进化方面的研究进展.微生物学通报,1982,(95):216~2215

FussonGB,PhaffHL.IntJSystBacterioI,1987,37:371~3796

KohnLM.DeveIopingnewcharactersforfungaIsystematics:An

experimentaI

approach

for

determiningtherankofresoIution.MycoIogia,

1992,84(4):589~592

8HameIinCR,OueIIetteGB,BernierL.AppIEnviroMicrogioI,1993,59:1752~17559

JOHANSONA,etaI.Theuseofspecies-specificDNAprobesfortheidentificationofMycosphaereIIafijiensisandM.musicoIa,thecausaIagentsofSigatokaofbanana.PIantpathoIogy1994,43:701~70710

StrongmanDB,MackayRM.DiscriminationbetweenHirsuteIIaIongicoIIavar.IongicoIIaandHirsuteIIaIongicoIIavar.cornutausingrandomampIified

poIymorphic

DNA

fingerprinting.

MycoIogia,1993,85(1):65~7011

VosP,etaI.AFLP:anewtechnigueforDNAfingerprinting.NucIeicAcidsResearch,23(21):4407~4414

12翁跃进,AFLP—

——一种DNA分子标记新技术.遗传,1996,18(6):29~3113

GIBCOBRL,InstrutionmanuaIAFLPTManaIysissystemIAFLPstarterprimerkit.1995

应用DNA分子进行真菌分类的原理及方法

作者:作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):被引用次数:

谢艺贤, 郑服丛

中国热带农业科学院植物保护研究所,海南儋州,571737

华南热带农业大学学报

JOURNAL OF SOUTH CHINA UNIVERSITY OF TROPICAL AGRICULTURE2000,6(1)5次

参考文献(13条)

1.GIBCOBRL,Instrution manual AFLPTM analysis system I AFLP starter primer kit 19952.翁跃进 AFLP--一种DNA分子标记新技术[期刊论文]-遗传 1996(06)

3.Vos P AFLP:a new technique for DNA fingerprinting[外文期刊] 1995(21)

4.Strongman D B;Mackay R M Discrimination between Hirsutella longicolla var.longicollaand Hirsutella longicolla var.cornuta using random amplified polymorphic DNAfingerprinting[外文期刊] 1993(01)

5.JOHANSON A The use of species-specific DNA probes for the identification ofMycosphaerella fijiensis and M.musicola,the causal agents of Sigatoka of banana[外文期刊] 1994

6.Hamelin C R;Ouellette G B;Bernier L 查看详情 1993

7.Gargas A;Taylor J W Polymerase chain reaction (PCR) primers for amplifying andsequencing nuclear 18S rDNA from lichenized fungi 1992(04)

8.Kohn L M Developing new characters for fungal systematics:An experimental approachfor determining the rank of resolution 1992(02)9.Fusson G B;Phaff H L 查看详情[外文期刊] 1987

10.周与良;邢来君 真菌的系统发育和进化方面的研究进展 1982(05)

11.Hanson L C Characterization of three Tremella species by isozyme analysis 199112.马国忠;余永年 凝胶电泳与腐霉属的分类 1991(03)

13.Hamamoto M;Sugiyama F;Komagata K 查看详情[外文期刊] 1997

引证文献(5条)

1.王斌.潘力.郭勇 RAPD分子标记在酱油生产菌系统发育分析中的应用[期刊论文]-微生物学通报2007(3)

2.潘力.王斌.郭勇 曲霉菌的RAPD分析及其在酿造工业中的应用[期刊论文]-微生物学报 2007(3)3.林剑伟.阙友雄.陈天生.许莉萍.张木清 核糖体DNA的内转录间隔区序列标记在真菌分类鉴定中的应用[期刊论文]-生物技术通讯 2007(2)

4.邓墨渊.王伯初.杨再昌.王黎 分子生物学技术在植物内生菌分类鉴定中的应用[期刊论文]-氨基酸和生物资源 2006(3)

5.张杰.康冀川.吴兴亮 灵芝属分子系统学研究进展[期刊论文]-贵州科学 2006(2)

本文链接:http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_hnrdnydxxb200001008.aspx

范文五:人类对细菌和真菌的利用 投稿:邹绖绗

人类对细菌和真菌的利用

课时 班级

2

任教年级

八年级

备 课人

知识与 技能

教 学 目 标

情感态 度与价 值观 过程与 方法

1 举例说出发酵技术在食品制作中的应用 2 说明食品腐败的原因,运用食品保存的一般方法保存食品 3 尝试制作甜酒、酸奶或泡菜 4 举例说出细菌和真菌与人类防治疾病的关系 5 说明细菌在环境保护中的作用 通过“演示实验”“观察与思考”等,明确细菌和真菌在食品制作中的作用 以及食品保存的一般方法。 通过做发酵实验和尝试制作甜酒 、泡菜酸奶等食品,提高学生的动手能力, 和实践能力。 认同细菌在环境保护中的作用 关注转基因技术在医药生产上的应用 发酵技术在食品制作中的应用 食品腐败的原因,运用食品保存的一般方法保存食品 甜酒和泡菜的制作原理,以及尝试制作甜酒、酸奶或泡菜等

教 学 重 点 教 学 难 点 教具学具准备 教 学 方 法 学 法 指 导

多媒体、 多媒体、课件

演示实验 演示实验 指导学生阅读、分析、 指导学生阅读、分析、讨论

教师活动

课前提问: 1 细菌和真菌在自然界中的作用有哪些? 2 作为分解者的细菌是怎样参与自然界的物质 循环的? 3 举例说明细菌和真菌对动物和人类造成的危 害 4 什么是共生?请列举细菌和动植物共生的事 例 引入新课: 细菌和真菌在自然界中的作用,既有有利的 一面,同时又有有害的一面,因此,我们应 该辩证的对待细菌和真菌。对于有害的一面 我们应该加以控制,对于有利的一面应该积 极的利用。那么人们是怎样来利用细菌和真 菌的呢?

1

学生活动

积极举手回答问题,小 组之间进行竞争

设计意图

回顾上节课所学 内容,引入新课

传授新课: 传授新课: 细菌、 一 细菌、真菌与食品的制作 提问: 1 同学们,想一想,人们在生活中是怎样来利 用细菌和真菌的?

通过问题引发学 学生思考后回答: 生思考,联系生 蒸馒头、做面包、酿酒、 活实际,激发学 制醋、腐乳等 生的学习兴趣 学生思考

2 同学们知道用这些细菌和真菌制作食品的原 理是什么吗?

演示实验: 演示实验: 教师展示课前准备的实验: 组织学生阅读课本 71 页演示实验中的文字,了解实验的过程。 思考并讨论下列问题: (1) 在温开水中加入一大勺糖和一小包酵母后 为什么要进行搅拌? (2) 为什么往瓶内要加入一些温开水? (3)认真观察瓶中的情况,你发现了什么? (4) 如果在瓶中不加入糖或者加入糖后将瓶放 进冰箱里低温保存,还会出现以上的现象 吗?为什么? 学生回答问题,教师引导总结 教师组织学生阅读 71 页最后一段,总结用细 菌和真菌制

作食品的原理。 发酵原理: 发酵原理: 酵母菌体内有多种酶, 能够将淀粉等糖类分解 成葡萄糖, 在无氧条件下, 会发生下面的反应:

酵母菌: 酵母菌

学生看了实验结果之后 都很兴奋,顿时产生了 浓厚的兴趣,积极主动 的看书,思考并回答上 述问题

展示实验结果, 激发学生学习的 欲望。

总结并识记发酵的原 理

淀粉 葡萄糖 酒精 + 二氧化碳 教师出示 :利用酵母菌制作的面包、馒头, 并特意显示里面的小孔。带学生充分观察后, 提出问题: (1)利用酵母菌制作的馒头、面包等为什么 松软多孔呢? (2)酵母菌在分解淀粉的过程中进一步把葡 萄糖转化为酒精并产生二氧化碳,可是, 我们蒸出的馒头为什么没有酒味?

2

通过学生的讨论

(3)有的人在制作馒头时总是留下一小块面 团(俗称“面引子” ,下次再做馒头时 ) 加入这块“面引子”就可以了。可是多 次循环之后,人们发现制作的馒头不如 以前的香甜了,有时甚至有一股酸溜溜 的味道,你能解释其中的道理吗? 过渡: 过渡: 教师肯定学生的答案,乳酸菌发酵会 产生乳酸,使蒸出的馒头不好吃。但是 乳酸菌也有好多用途呢。谁能说出一些 乳酸菌的作用呢? (制作泡菜,酸奶等) 教师提问: 教师提问: 细菌和真菌在食品制作中的应用是非常广泛 的,哪位同学能够再举出一些具体事例呢? 学生小组内可以讨论交流得出结论。 教师出示利用细菌和真菌制作的食品图片, 教师出示 进一步加深学生的认识。

学生小组讨论, 达成共 识后,班内展示

分析,增强学生 的分析总结能 力,及合作能力

学生观察,加深对发酵 食品的了解

增进学生对发酵 食品的了解,引 起学生对发酵食 品的关注

探究制作甜酒: 探究制作甜酒: 指导学生阅读 72 页“制作”中的文字内容 思考并讨论: (1)题以及“制作”中的问题 学生阅读课本, 然后讨 (1) 利用酒曲和糯米制作甜酒的过程中, 酒曲 论分析达成共识后回 的作用是什么?糯米的作用是什么? 答问题 教师小结: 教师小结: 发酵食品的制作离不开细菌和真菌。 制作发酵 食品时应该为细菌和真菌提供适宜的生存条 件(营养物质,温度等) 布置作业: 布置作业: 利用课余时间尝试制作甜酒, 下一 节课把自己制作的天就带来与大家共同品尝。 第二课时: 第二课时 细菌、 二 细菌、真菌与食品的保存 1 教师出示:发霉的橘子、长出“毛毛”的馒 教师出示: 头、变质的牛奶等提出思考的问题: 观察、阅读、小组讨论 (1)食品发霉、腐败的原因是什么? 分析,代表发言回答问 (2)应该采用什么措施使食品保鲜? 题 2

学生带着问题阅读课本 73 页的文字回答问题 3 组织学生分组讨论分析 73 页的 “观察与思考” 中的问题 。 4 学生表达本组同学的看法,教师适时给予肯 定和表扬。

3

增进学生关注生 活实际,利用所 学知识解决实际 问题的能力

细菌、 三 细菌、真菌与疾病防治 1 引导学生回忆在第一节学习的某些细菌和真 菌引起的多种疾病。 2 提问:当患扁桃体炎时,医生采用什么药物 治疗? 学生根据已有的知识回答上述问题,教师出示 啊莫西林胶囊的使用说明书,加深学生学习的 积极性。 教师小结: 细菌和真菌可以引起许多疾病,但是,当我们 生病的时候也可以用某些菌类提取的抗生素杀 死致病细菌,达到治疗的目的。 3 指导学生阅读 76 页“抗生素今昔” 。引导学 生正确认识科学研究与技术进步的社会价 值,讨论课后第 2 题。 过渡: 过渡:某些菌类可以直接提取并产生抗生素, 科学家还可以利用现代技术手段,把其他生物 的某种基因转入细菌内部,使这些细菌能够生 产药品。出示胰岛素生产车间图,并提出下列 问题: (1)利用大肠杆菌生产胰岛素有什么优点? (2)利用基因技术还可以生产哪些药物? 学生讨论后回答,教师及时给予鼓励和肯定。 过渡: 过渡:目前转基因技术是国际热点问题,生物 科学技术的迅猛发展,已延伸到各个领域。今 年来,科学家已经成功地运用细菌来处理某些 环境污染问题。 四 细菌与环境污染 展示材料: 展示材料:中央电视台《走进科学》栏目曾播 出现代农民,已经利用杆菌和甲烷菌来分解人 及动物粪便和生活污水从而产生甲烷气体,甲 烷作为一种燃料,为农民提供照明、取暖燃料 及发电。盖沼气池不但节约了经济,还减少了 环境污染。可见细菌和环境保护已经进入人们 的生活。 教师根据展示的材料,提出下面的问题: (1) 你了解沼气池吗?沼气是怎样产生的? (2) 污水处理净化污水的原理是什么是怎样净 化生活污水和工业废水的? 小结: 小结:

4

学生结合生活实际回答 问题

阅读课本 76 页 “抗生素 今昔” ,了解抗生素, 讨 论课后第 2 题并回答。

通过资料,进一 步形成辩证的看 待问题的观点

进一步加深学生 对生物反应器的 认识

分析资料,思考上述问 题

学生阅读课本 75 页的 文字内容,阅读展示的

随着世界性能源危机和环境污染问题的产生, 材料后思考并讨论上述 利用分解各种有机物来获得能源,并使各种有 问题,达成共识后回答 机物得到净化处理,已经成为获得新能源和保 问题。 护环境的重要手段之一。 课堂小结: 课堂小结: 细菌和真菌在自然界中的作用,既有

有利的一 面,又有有害的一面,因此,我们应该辩证的 对待细菌和真菌。对于有害的一面我们应该加 以控制, 对于有利的一面应该积极地加以利用, 让它们为人类造福。

5

范文六:人类对细菌和真菌的利用 投稿:钟捭据

《人类对细菌和真菌的利用》教学设计

●教学目标 一、知识目标

1.通过演示实验和制作甜酒使学生明确——许多食品的制作都要利用细菌和真菌。 2.探究食品腐败原因,使学生明确——食品的保存与细菌、真菌有关。 3.多种疾病的防治与细菌和真菌有关。 4.研究细菌和环境保护的关系。 二、能力目标

1.通过观察演示实验——发酵现象,培养学生比较、分析思考能力。 2.通过多媒体演示,培养学生观察和收集信息能力。 3.通过分组实验,培养学生动手能力及协作解决问题能力。

4.通过探究“食品腐败原因”,学以致用想方设法采取一定技术手段解决生活中的食品腐败问题。 三、情感目标

1.通过对本节学习,使学生辩证地看待细菌和真菌,培养辩证唯物观点。

2.通过本节学习,激发同学学习生物兴趣,热爱自然科学情愫,激发同学的创造激情。 3.通过本节学习,培养同学关注生活现象、放眼世界,关注社会的责任心。

●教学重点

1.发酵现象及发酵食品制作离不开细菌和真菌。 2.食品腐败的原因及食品保存的主要原理。

3.人类利用细菌和真菌对疾病的防治及利用细菌保护环境。

●教学难点

1.发酵现象及发酵食品离不开细菌和真菌。 2.食品防腐败的保存办法。

3.探究细菌和真菌对生活污水处理办法。 4.认识细菌、真菌与疾病防治。

●教学方法

实验法(演示实验、对照实验、分组实验)、多媒体演示法、“观察—讨论—归纳”法

●教具准备

1.教师准备:

(1)温开水、糖1斤、酵母、玻璃瓶(或矿泉水瓶)、小气球若干个;课外活动小组已准备好的发酵实验挑选效果明显的一组;

(2)有关食品保存的多媒体课件;有关污水处理的多媒件课件或电视节目。

(3)酒曲三块、浸泡一昼夜的糯米4500 g(即9斤)分成三份、凉开水、清洁容器、蒸馏水、清洁筷子、清洁蒸布若干块。

2.学生准备:

(1)收集各类药物说明书(特别注意是抗生素药物的);食品保存方法(从日常生活中收集)有关处理污水的信息收集。

(2)各类酸奶袋或瓶。

●课时安排 2课时

第一课时

●教学过程

[创设热点情境,导入新课]

教师:当前科学技术突飞猛进,尤其是生物科学技术,克隆技术、转基因药品、干细胞移植等都是人们关注热点。另外国际重大事件中炭疽热、核泄漏、生物武器等,也是人们关心的焦点。请同学们注意,我刚才说到的热点和焦点信息中,你能指出哪些是和细菌、真菌有关吗?

学生抢答:转基因药品和炭疽热、生物武器。

教师:很好,看来同学们收集信息能力很高。什么是转基因药品,什么是炭疽热呢?还是让我们先来重新认识一下细菌和真菌吧。

请同学们列举已学过的细菌或真菌。

学生(举手做答):学过的细菌有枯草杆菌、根瘤菌、链球菌、肺炎球菌、醋酸杆菌、乳酸杆菌等。学过的真菌有霉菌、酵母菌、蘑菇等。

(学生回答不全,允许其他学生补充)

教师:哪些是对人类有利的?哪些是对人类有害的?

学生:(讨论后做答)有利的包括根瘤菌、醋酸杆菌、乳酸杆菌、曲霉、酵母菌、食用蘑菇等;有害的是枯草杆菌、链球菌、肺炎球菌、青霉等。

教师:很好。平常一提起细菌和真菌,人们往往只想到它们的害处,其实,很多细菌和真菌对人类是有益的。看来,我们这节课要给细菌和真菌“平反昭雪”了。

板书:第二节 人类对细菌和真菌利用

教师:(拿出课外活动小组已做好的有关发酵现象的实验,其实验效果接近书P71页上发酵现象图)请同学

观察我拿出的这个瓶有何特点?

学生:(认真观察之后做答)瓶内不断有气泡产生,瓶口套的小气球在不断地膨胀变大。 教师:同学们观察的很细,原来小气球胀大的原因是因为瓶内不断产生气体的原故。 同学们,为什么瓶内会不断产生气体呢? 你想知道我放进瓶里的是什么东西吗? 学生:想知道!

教师:这个问题,请生物课外小组的同学回答。 课外小组同学:瓶内放进了糖和酵母。

教师:原来,瓶内放进了糖和酵母,就会产生气泡把小气球吹起来。那好,我们请同学当场做实验证明。 学生活动:按书P71演示实验开始进行实验。

●学生1:介绍实验用具,即玻璃瓶或矿泉水瓶、糖、酵母、小气球、温开水 ●学生2:介绍实验步骤

●学生3:具体操作。操作步骤如下:(a)先将温开水中倒入一大勺糖和一小包酵母,搅拌,倒入玻璃瓶或矿泉水瓶,再往瓶内放入一些温开水。(b)将一瘪小气球套在瓶口。

(实验完毕)

教师:同学们看,刚装好的瓶里有没有气泡产生,小气球胀了没有? 学生:摇头叹气。 教师:为什么?

学生:(讨论、分析原因)放的时间短,应放在温暖的地方才会有气泡。 教师:好,那我把瓶放在教室窗台上,同学们可记住每天观察。

接下来,老师倒有一个问题要问同学们:记得刚才做实验的同学放到瓶子里的是糖、酵母和水,没有气体呀!可为什么在温暖的地方放置一段时间就会产生气泡?

学生:(讨论后应答)因为酵母把糖分解了,产生了二氧化碳气体。小气泡就是二氧化碳气体。 教师:太感谢同学们能给出答案。其实,这便是我们日常生活中常说的“发酵现象”。 板书:发酵现象

[对实验拓展—延申—应用,归纳细菌、真菌与食品制作]

教师:同学们请继续观看讲桌上瓶子(已具实验效果的瓶子),如果这里面我放的不是糖,而是面粉和酵母;如果不是糖和酵母,而是牛奶和乳酸菌,如果不是牛奶和乳酸菌,而是麸皮、小米、红粮混在一起再放入醋酸菌;如果不是这样,我又换成糯米,接种上曲霉,那又会是什么样呢?„„接下来,请同学们阅读P71第二自然段,再做答。

学生:积极阅读,急于想找到答案,数分钟后解答: (1)酵母分解面粉,会使面团发酵;

(2)乳酸菌可分解牛奶,会使牛奶发酵而制作成酸奶; (3)醋酸菌会使麸皮、小米和红粮发酵,制作出醋。

(4)曲霉能分解糯米,使糯米发酵而制作出酒。

教师:非常欣赏同学们的判断能力,同学们的表现令老师佩服。化学反应式详解发酵现象(见课件)。 好,现在,我们便来了解甜酒的制作过程。

阅读课文,掌握方法。具体实施让学生课后进行并完成实验报告。 教师:用多媒体课件打出实验报告单及实验注意事项。

1.发酵现象

2.利用细菌制作食品:酸奶、泡菜、醋、利用真菌可制作食品:馒头、面包、酒、酱油等。 3.甜酒的制作过程:

附:实验报告单_____________年_____________月_____________日_____________组

本节课,我们通过做实验认识了发酵现象,并认识到细菌、真菌与食品制作息息相关,并亲自操作了甜酒的制作实验,本实验持续时间较长,请注意观察及实验结果。(3天后可开盖)

[巩固练习]

1.蒸馒头时,使用下列哪种物质 A.乳酸菌 答案:D

2.酸奶食品利用的菌是_____________。 答案:乳酸菌

3.试分析乳酸菌制作酸奶的过程。

答案:方法步骤:(1)选奶粉混水,加热,冷却(消灭杂菌的过程)。(2)分装洁净,巴氏消毒(60℃,30分钟煮过)后的瓶。(3)接种,将市售的酸奶分倒入各瓶,密封。(4)置入18℃左右保温箱内。(5)一周后便可变成酸奶。

●板书设计

第二节 人类对细菌和真菌的利用

一、细菌、真菌与食品制作 1.发酵现象

2.利用细菌制作食品:酸奶、泡菜、醋等,利用真菌可制作食品:馒头、面包、酒、酱等。

●活动与探究

1.请同学回家亲自用干酵母蒸馒头,蒸熟后可带来学校互相品尝。 2.继续收集信息:a.有关食物保存的。 b.有关药物的说明书,并分类。

c.有关生活中处理污水的。生活环境周围是否有污水处理站。

B.曲霉

C.醋酸菌

D.酵母菌

d.收集酒瓶标签上标明酿酒原料常见有哪些?

第二课时

●教学过程

[复习导课,引出食品保存方法]

教师:上节课,我们认识了发酵现象,了解到发酵食品的制作离不开细菌和真菌。并且同学们亲手酿制了甜酒。有些同学也尝试制作了酸奶。那同学们,咱们制作的酸奶能长期保存吗?

学生:不能。第一天,我喝自己做的酸奶还好喝,到第二天便变味了。 教师:是酸奶变质了。请问,你把制出来的酸奶放在什么地方了? 学生:放在桌子上。

教师:其他同学能找到酸奶变质的原因吗? 学生:没有保存好,酸奶才变质。

教师:对极了。请同学们讲,日常生活中,除了酸奶,你还见过哪些食物变质现象? 学生:变馊的米饭、腐烂的鱼内脏、发臭的肉汁、腐烂的菜叶„„

教师:如何防止它们的腐烂呢?这节课,咱们便来认识一些具体的保存食物方法。 [认识食物保存方法,探究食物腐败原因]

教师:请同学们查找手中所拿酸奶袋或瓶上有没有食物保存方法,保存日期。 学生:(积极查找)的确有。有的是常温,6个月;有的是-4℃,15天。 教师:除了酸奶,你还知道哪些食物保存方法? 学生1:用冰箱把肉冷冻起来,把馒头冷藏起来。 学生2:用盐把蔬菜腌起来,做成咸菜。 学生3:把肉做成罐头,把水果也做成罐头。 学生4:„„

教师:同学们说得非常好。下面请同学们根据自己的生活经验完成以下连线题,然后请同学们看一些食品保存图片,请你尽力记录有多少种保存办法。

多媒体课件播放内容 学生:仔细观察,紧张记录。

教师:请试列举刚才所看到的食物保存方法。 学生:(1)低温保存鱼 (2)真空保存熟肉制品 (3)干燥保存香菇等干果

(4)巴氏消毒法保存牛奶 (5)高温瞬时杀菌的牛奶、啤酒等 (6)糖溃保存鲜果制成果脯 (7)熏蒸保存肉制品

(如果答不上来,教师可重新播放一遍课件学生再答。课件可播三次) 教师:请同学再来总结一下书P73页图中有哪些保存方法。 学生:仔细看图,及时总结。

教师:(可叫中下或差生来做答,以培养他们学习兴趣和学习自信心。答对者要及时表扬。)

教师:为使食品能放置更长时间,人们还往食物中添加了防腐剂,如肉制品中添加了亚硝酸盐,饮料中添加了山梨酸钾等。那么,这些食品保存的方法都可以达到防止食品腐败变质的目的。而食品腐败的原因是什么呢?请同学参见书P73中第一自然段。

学生:食品腐败变质主要是由细菌和真菌引起的,这些细菌和真菌可以从食品中获得有机物,并在食品中生长和繁殖,导致食品腐烂。

教师:可见,防止食品腐败所依据的主要原理就是把食品内的细菌和真菌杀死或抑制它的生长和繁殖。 板书:二、细菌、真菌与食品保存 1.食品腐败原因 2.食品保存办法

[探究细菌、真菌与疾病防治情况及细菌与环境保护关系]

教师:食品的制作离不开细菌和真菌,而细菌和真菌也可以使食物腐败。同样,细菌、真菌可以使动植物和人患病,人也可以利用细菌和真菌来对疾病进行防治。

板书:三、细菌、真菌与疾病防治

教师:请同学们查看自己收集到的各种药品说明书,特别是有关抗生素的说明书。并结合书P74页第一自然段,对抗生素有所了解。

学生活动1:明确抗生素是由真菌产生的,用来杀死致病细菌的。

学生活动2:阅读了《阿莫西林胶囊说明书》,认识到阿莫西林胶囊是一种真菌——青霉菌产生的青霉素,通过抑制细菌细胞壁合成而发挥杀菌作用,可使多种细菌迅速成为球状体而溶解、破裂。如肺炎链球菌等,所以青霉素可治疗肺炎等多种疾病。

教师:科学家利用细菌繁殖速度很快这一特点,利用细菌,把生物某种基因转入细菌内部,使细菌能生产出药品,以满足临床药物的供给,减轻病人的痛苦。这种药品叫“转基因药品”。

请同学们分析一下课本中所提到的“转基因药品”——胰岛素的生产过程。

学生:首先剪切胰岛素基因,再将胰岛素基因转入人的大肠杆菌内,再创造大肠杆菌裂殖的有利环境,对大肠杆菌进行大规模培养,使之产生大量的治疗糖尿病的药物——胰岛素。(可选2~3名同学试讲)

教师:非常棒。目前转基因技术是国际热点问题,希望同学们积极收集有关资料,关注我国转基因和国际上其他国家对转基因的研究的进展情况。紧跟时代发展,千万不可掉队。

板书:三、细菌、真菌与疾病防治 1.真菌与疾病防治——有关抗生素药品 2.细菌与疾病防治——有关转基因药品

教师:为使同学们更深了解“转基因”这个新名词,老师找到了相关资料提供给同学们阅读(用多媒体课件或投影片打出)

[承上启下,导入细菌与环境污染的问题]

教师:可见,生物科学技术的迅猛发展,已延伸到各个领域。近年来,科学家已经能够成功地运用细菌——来处理某些环境污染问题。

板书:四、细菌与环境污染

教师:请同学们回忆第一节《细菌、真菌在自然界的三大作用》中所讲到的第一个作用是什么? 学生:细菌、真菌做为分解者,参与物质循环。 教师:能具体说明它们是怎样参与物质循环的吗?

学生:细菌、真菌把动植物遗体分解成二氧化碳、水和无机盐,这些物质又能被植物吸收和利用,进而制造有机物。

教师:很好。在我们的生活污水、工业废水和生活垃圾中,其实还有很多的有机物,这些有机物是不是可以作为细菌、真菌的食物呢?

学生:可以呀!

教师:科学家正是利用细菌、真菌的这一点来处理一些环境污染现象,从而进行环境保护的。请同学们就

收集的资料来讲一下,有一些什么具体操作办法?

●学生1:根据细菌在有氧条件下,能将有机物分解成二氧化碳和水,所以污水处理厂,主要通过曝气池,向污水中提供充足的空气,从而使污水中的有机物彻底分解为二氧化碳和水,达到污水净化的目的。

●学生2:根据细菌在没有氧的环境中,将有机物发酵或沼气(主要含甲烷)。随着世界性能源危机和环境污染问题的产生,利用沼气池分解各种有机物来获得能源。并使各种有机废物得到净化处理,已经成为获得新能源和保护环境的首要手段之一。

电视《走进科学》栏目曾播出现代的农民,已经利用杆菌和甲烷菌来分解猪(人)粪便和生活污水从而产生甲烷气体,甲烷气体作为一种燃料,为农民提供照明、取暖和燃料及发电。记得电视上说,盖沼气池大约需花费一万来块钱。

可见,细菌和环境保护已进入人们的生活。

说明细菌与环境保护的关系,又站到了现代生物发展的前沿,可见,同学们是十分有潜力的。 板书:四、细菌和环境保护

1.有氧条件下——细菌将有机物彻底分解 2.无氧条件下——可制成甲烷气体做为燃料 3.污水处理原理——利用微生物将其中的有机物分解 [课堂小结]

感谢同学们能够课下认真收集资料,特别是有关《细菌、真菌与疾病防治》《细菌与环境保护》有关信息,对于老师来讲有收藏价值,希望同学们更加努力,将来都成为有用之才。

[巩固练习]

教师出题也可,但由于本节课学生活动较多,所以也不妨尝试同学自命题形式。 参考题目:

1.食品保存有几种方法?试例举日常生活中常见的几种。 答案:a.低温保存:利用冰箱、冰柜保藏食物; b.干燥保存:五谷杂粮、香菇、干果等 c.巴氏消毒法:保存牛奶、啤酒等 d.高温瞬时杀菌:牛奶、啤酒等

e.盐渍加糖渍保存:保存各种食物如咸菜、果脯等 f.防腐剂保存:肉制品、饮料、酱油等 g.酸性保存:如泡菜

h.熏蒸保存:如熏肉、熏肠等肉食

2.细菌在有氧条件和无氧条件下活动情况是否相同?

答案:细菌在无氧条件下分解有机物不彻底,产生的是中间产物,如杆菌和甲烷菌在无氧条件下将有机物分解成甲烷气体;在有氧条件下,能彻底分解有机物,产生二氧化碳和水。

●板书设计

二、细菌、真菌与食品保存 1.食品腐败原因 2.食品保存方法

三、细菌、真菌与疾病防治。

1.有关抗生素类药品——真菌与疾病防治 2.细菌与疾病防治——有关转基因药品 四、细菌与环境保护

1.有氧条件下——细菌将有机物彻底分解 2.无氧条件下——可制成甲烷气体作为燃料 3.污水处理原理——利用微生物来分解有机物 (另:后附《阿莫西林胶囊说明书》一份)

●活动与探究

1.继续关注细菌、真菌与食物保存、与疾病防治、与环境保护的各种科学信息及最新动态。 2.比一比,看谁的西红柿保鲜时间最长。

附:阿莫西林胶囊说明书 药品名称:

通用名:阿莫西林胶囊 英文名:Amoxicillion Capsules 汉语拼音:Amoxiling Jiaonang

本品主要成分为阿莫西林,其化学名为(2S,5R,6R)-3,3-二甲基-6-[(R)-(-)-2-氨基-2-(4-羟基苯基)乙酰氨基]-7-氧代-4-硫杂-1-氮杂双环[3.2.0]庚烷-2-甲酸三水合物。

其结构式为:

分子式:C16H19N3O5S·3H2O 分子量:419.46 性状:本品为胶囊剂。

药理毒理:阿莫西林为青霉素类抗生素,对肺炎链球菌、溶血性链球菌等链球菌属、不产青霉素酶葡萄球

菌、粪肠球菌等需氧革兰阳性球菌,大肠埃希菌、奇异变形杆菌、沙门菌属、流感嗜血杆菌、淋病奈瑟菌等需氧革兰阴性菌的不产β-内酰胺酶菌株及幽门螺杆菌具有良好的抗菌活性。阿莫西林通过抑制细菌细胞壁合成而发挥杀菌作用,可使细菌迅速成为球状体而溶解、破裂。

范文七:人类对细菌和真菌的利用 投稿:蒋錉錊

八年级上期生物导学案

拓展阅读

我国规定的常见食品防腐剂种类及其使用范围

苯甲酸及盐(苯甲酸钠/苯甲酸)

碳酸饮料、低盐酱菜、蜜饯、葡萄酒、果酒、软糖、酱油、食醋、果酱、果汁饮料、食品工业用桶装浓果蔬汁. 山梨酸钾

除同上外,还有鱼、肉、蛋、禽类制品、果蔬保鲜、胶原蛋白肠衣、果冻、乳酸菌饮料、糕点、馅、面包、月饼等. 脱氢乙酸钠

腐竹、酱菜、原汁桔浆. 对羟基苯甲酸丙酯

果蔬保鲜、果汁饮料、果酱,糕点陷、蛋黄陷、碳酸饮料、食醋、酱油 丙酸钙

生湿面制品(切面、馄饨皮)、面包、食醋、酱油、糕点、豆制食品. 双乙酸钠

各种酱菜、面粉和面团中。 乳酸钠

烤肉、火腿、香肠、鸡鸭类产品和酱卤制品等。 乳酸链球菌素

罐头食品、植物蛋白饮料、乳制品、肉制品等. 纳他霉素

奶酪、肉制品、葡萄酒、果汁饮料、茶饮料等。 过氧化氢

生牛乳保鲜,袋装豆腐干

范文八:人类对细菌和真菌利用 投稿:王澸澹

年级

生物

新授课

学案

自学收获

备课人:

时间 :

11

25

学习内容: 第五单元第四章第五节: 人类对细菌和真菌的作用 学习目标: 1 举例说明人类对细菌和真菌的利用。 2 说出发酵技术在食品制作中的应用。 3 说明食品腐败的原因。 4 尝试制作米酒。 5 关注细菌和真菌在食品制作、食品保存、疾病防治、清洁能源和环境保护的利用。 重 点:目标 1 难 点:目标 4、5

10)整个培养过程中,为什么要采取保温措施?(从细菌和真菌繁殖的条件来考虑) 11)思考制作米酒的过程中要保持清洁,避免油腻,这样做是为什么? 课外知识拓展: (酵母菌一般属于兼性菌。在发酵前期一般采取需氧因为那样可以加速菌体的繁殖。后期大 多采用厌氧或缺氧目的是为了获得次级代谢产物。也就是发酵的目的。 (二)细菌、真菌与食品的保存: 阅读课本 86 页的“观察与思考” ,仔细观察图片: 1 食品腐败的原因是什么? 防腐的重要问题是什么? 2 防腐所依据的主要原理是什么? 3 图中有几种保存食品的方法?它们所依据的原理是什么? 食品种类 干蘑菇 咸鸭蛋、咸菜 腊肉 果脯、蜜枣 盒装牛奶 速冻水饺 罐头 火腿 4 这些食品保存的方法,有什么共性? (三)细菌、真菌与疾病防治: 阅读课本 81 页的第一段,思考: 1 什么是抗生素? 2 抗生素如何生产? (四)细菌与清洁能源和环境保护: 细菌净化环境的原理是什么? 保存方法 保存原理(破坏细菌和真菌繁殖的什么条件)

一、自主学习:

(一)细菌、真菌与食品的制作: 阅读课本 84 页到 86 页的文字,思考以下几个问题: 1 哪些食品的制作,利用了细菌和真菌?各种食品,用的是什么菌种? 它的反应原理是什么?请你完成列表格。 食品名称 面包和馒头 牛奶、酸菜 醋 酱油 酒 2 制作米酒: 1)了解实验材料。 2)了解制作酒曲的步骤。 3)回顾培养细菌和真菌的步骤:_______→_______→_______→_______。 4)步骤(1) 、 (2)相当培养细菌和真菌的哪个步骤? 5) (3)步骤相当培养细菌和真菌的哪个步骤? 6) (4) 、 (5)步骤相当培养细菌和真菌的哪个步骤? 7)步骤(2)中,米饭为什么要煮熟?煮熟的米饭为什么要用凉开水冲淋一次?能不能 用生水,为什么?中间为什么要挖个坑? 8)加入酒曲的目的是什么? 9)酿酒的过程中,为什么要将器皿密封?(从细菌和真菌繁殖的条件来考虑) 自学疑惑 菌种的类型 反应原理 淀粉→_______→_________+________ 淀粉→葡萄糖→_________ + ________

(五)归纳总结:

总结归纳人类对细菌和真菌的利用有哪些方面?

二、小组合作:

1、

讨论(一)1、 (二) 、 (三) 、 (四) 2、讨论(一)2

三、展示反馈: 四、当堂检测:

同步解析与测评“基础闯关” 、 “课堂知识延伸” (选作)

范文九:真菌的分类与命名 投稿:孙赳赴

・54・・继续教育・

真菌的分类与命名

徐德强 肖义平

(复旦大学生命科学学院,上海200433)

【关键词】 真菌;分类;命名

【中图分类号】 R372  【文献标识码】 B  【 ()0120054203

真菌(True(即广义的Fungi),胞核、,以腐生、寄生、共生或超寄生(superparasitic)方式吸收养料,仅少数为单细胞,其他都有分支或不分支的丝状体,细胞壁含有几丁质和葡聚糖,能进行有性和(或)无性繁殖,产生的孢子大多数无鞭毛,当有鞭毛时也无鞭茸毛,且分布十分广泛的一群细胞生物。它们与人类关系密切。其中许多真菌对人类是有益的,如可被用于抗生素、酶制剂、有机酸等生产,另一些还可被用于环境污染治理、植物病虫害的防治等。此外,还有些真菌可侵犯动、植物及人类,引起各种真菌病(Mycosis)等。1 真菌的分类

胞壁的主要成分是纤维素,细胞为双倍体,具有鞭

茸毛的鞭毛,GC含量高于接合菌。此外,其rDNA序列也和真菌(TrueFungi,即狭义的Fungi)有差异,表明卵菌是不属于真菌的另一个类群。越来越多的研究表明,黏菌和卵菌在生物演化的早期都与真菌有所分化。在现代的生物八界系统(Cavalier2Smith,198821989)中,

它们均属于和真菌不同的界

真菌早在几千年前就被人类认识和利用,但对

真菌的系统研究仅有200多年的历史。自1729年Michei首次对真菌(现在称作菌物,即广义的Fun2gi)进行分类以来,有代表性的真菌分类系统不下10多个。如DeBary(1884)、Martin等(1950)、Whit2taker(1969)、Margulis(1974)、Alexopoulos(1979)、Kendrick(1992)、Alexopoulos&Mins(1996)、Ain2sworth等(1973,1983,1995,2001)等的分类系统

等。前期得到学术界较广泛采用的是Ainsworth等(1973)的分类系统,该系统主要依据营养方式、胞壁成分和形态特点将真菌分为黏菌门和真菌门,后者又分为5个亚门、18纲、66目、244科(见图1)。

根据近年来超微结构、生物化学及分子生物学的研究,已经明确过去所称的真菌(即广义的Fun2gi)是多元起源和演化的,尤其是其中的卵菌,其细

作者简介:徐德强(19512),男(汉族),副教授.E2mail:dqxu@fu2

dan.edu.cn

图1 Ainsworth等(1973)分类系统图

Fig.1 Ainsworth’sclassificationsystemoffungi(1973)

・55・

[卵菌和黏菌分别归入假菌界(KingdomChromista)(《安・贝氏菌物词典》第9版,2001)。

和原生动物界(KingdomProtozoa)]。

此外,《安・贝氏菌物词典》第8版(AinsworthandBisby’sDictionaryofthefungi,eighthedition,1995)和第9版(2001)也均将以往所称的真菌(广义的Fun2gi,即菌物)列入真核生物域(DomainEukaryota)的3个界,即真菌界、原生动物界和假菌界。其中,第9版(2001)中,真菌界包括4门和1类(见图2)。其中壶菌门菌体为单细胞、单细胞具须或无隔多核、分枝菌丝体,细胞壁为几丁质(段)。无性阶段产生具1孢子(罕见多鞭毛),、休达菌丝体或虫菌体,,细胞壁由几丁质和壳聚质组成。无性阶段主要产生孢囊孢子,有性阶段产生接合孢子。子囊菌门菌体丝状,有隔,少数为单细胞,细胞壁为几丁质。无性阶段常产生分生孢子,有的产生厚垣孢子,有性阶段产生子囊孢子。担子菌门菌体丝状、有隔,大多有锁状联合。无性阶段产生分生孢子、节孢子或粉孢子等,有性阶段产生担孢子。无性型真菌类菌体大多为有隔菌丝体,少数为单细胞。无性阶段主要产生分生孢子,有性阶段缺乏或未发现。

壶菌门包括2纲、6目、17科、123属、914

3

真菌界中与医学关系密切的为接合菌门、子囊

菌门及无性型真菌类,此外,担子菌门中也有少数种类与之有关。

3

接合菌门包括3纲、15目、38科、181属,约1090种(第9版,2001)。)中。其中毛霉科())、小克银汉霉)和共头霉科(Syncephalas2),引起人的接合菌病(Zygomyco2psis)。此外,接合菌纲虫霉目(Entomophthorales)中也有少数人类致病菌,如该目中的虫霉科(Ento2mophthoraceae)中的裂孢蛙粪霉(Basidiobolusranarum)等菌种可引起人类的皮肤病。

子囊菌门包括7纲、56目、226科、3409属、32739种(第9版,2001)。与人类致病有关的真菌有内孢霉科(Endomycetaceae)和酵母科(Saccharo2mycetaceae)中酵母属(Saccharomyces)的少数种。此外,裸囊菌科(Gymnoascaceae)和散囊菌科(Eu2rotiaceae)中也有一些人类致病菌,如皮炎芽生菌(Blastomycesdermatitidis)的有性期,皮炎阿耶罗

3

菌(Ajellomycesdermatitidis);组织胞浆菌(Histoplastoma)的有性期,伊蒙菌(Emnoniella);小孢子菌(Microsporum)和毛癣菌(Trichophyton)的有性期,节皮菌(Arthroderma);构巢曲霉(Aspergillusnidulans)的有性期,构巢裸壳胞菌(Emericellanidulans)。另外,还有假性阿利什霉(Pseudallescheria)及毛结节菌(Piedraia)等。担子菌门包括4纲、33目、130科、1353属、29914种(第9版,2001)。人类致病菌主要为新生隐球菌(Cryptococcusneoformans)的有性期,即新生拟线黑粉菌(Filobasidiellaneoformans)。无性型真菌类包括不具有或尚未发现有性阶段的真菌(即以往称为半知菌、不完全菌或有丝分裂孢子真菌等)。第9版(2001)仍接受传统分类中该类真菌的3个形态菌群[即过去所称的丝孢纲(Hyphomycetes)、腔孢纲(Coelomycetes)和无孢纲(Agonomycetes)],但不作为正式分类单位。目

3

前本类真菌共包括2600属,15000种。致病菌有隐球菌属、念珠菌属(Candida)、红酵母属

注:3《安・贝氏菌物词典》第9版(2001)中,真菌各门提及的纲中,有些纲未被最终接受,见真菌界4门1类划分情况。此外第9版中无性型真菌类未介绍属数和种数,上述所列数据来自第8版(1995)。

3

图2 Ainsworth等真菌分类系统图(2001)

Fig.2 Ainsworth’sclassificationsystemoftruefungi(2001)

・56・(Rhodotorula)、毛孢子菌属(Trichosporon,即丝spp.表示若干种曲霉。发表新种或新变种时,其学

孢酵母属)、曲霉属、青霉属(Penicillium)、芽生菌

属、球孢子菌属(Coccidioides)、组织胞浆菌属、着色霉属(Fonsecaea)、表皮癣菌属(Epidermophton)、枝顶孢属(Acremonium)、小孢子菌属、毛癣菌属、副球孢子菌属(Paracoccidioides)、孢子丝菌属(Sporothrix)、瓶霉属(Phialophora)、外瓶霉属(Exophiala)、枝孢霉属(Cladosporium)、喙枝孢

名后加上sp.nov.或var.nov.

国际命名法规定,一种真菌只能有一个属名和种名加词。如果一种真菌的生活史中具有性和无性阶段,则按有性阶段所起的名称是合法的。无性型真菌(半知菌),它们的命,一旦发现其有性阶,。但有些,经常出现无性阶段,另偶尔,因此仍用其无性阶段的名称,如、青霉属及小孢子菌属等均为无性阶段的名称。

此外,为了保证“名称”有精确、能为大家所了解的意义,命名法还规定凡报告一个新的属或种时,不论用何种文字发表,必须附有适当的拉丁文特征集要。

在真菌分类中所应用的分类单位和其他生物中应用的一样,即域、界、门、亚门、纲、亚纲、目、亚目、科、亚科、属、种,其中属以上的单位都有一定的词尾。如门:2mycota;亚门:2mycotina;纲:2mycetes;亚纲:mycetidae;目:2ales;亚目:2ineae;科:2aceae;亚科:2oideae。属以下一般无固定的词尾。种下又可分为亚种、变种、亚型、专化型和生理小种等。

参考文献

[1] 张纪忠主编.微生物分类学.上海:复旦大学出版社,1990[2] 邢来君,李明春.普通真菌学.北京:高等教育出版社,1999[3] 中国科学院微生物研究所.常见与常用真菌.北京:科学出

属(Rhinocladiella)和维朗那霉属(Veronaea)等。此外还有一些条件致病菌。2 真菌的命名

以“双名制”。双名制

是瑞典植物学家Linneaus(1753年)创立。生物的双名制的名字就是所谓的学名。一种真菌的学名是用拉丁词或拉丁化的词构成。第一个词是属名,通常用拉丁文的名词,属名第一个字母必须大写。第二个词是种名加词(或种的加词),一般是形容词,字首一律小写。最后加上命名人的姓和命名年份(一般使用时,命名人的姓和命名年份可省略)。在出版物中,真菌学名应排成斜体字,在书写时,应在学名之下划一横线,以表示它应是斜体字母。

真菌的属名和种名加词往往是指产生孢子的方式,孢子的特点、菌落颜色或质地、气味或其他较显著的特征。此外,有些真菌的属名或种名加词用以对某真菌学家表示敬意,将其姓定为种名加词或属名。也有种名加词是由地方名称衍生而来或指生存场所。另再有一些寄生真菌的种名加词来自寄主植物的属名。下面举例说明:黄曲霉(AspergillusflavusLink1809),第一个词曲霉属(原意是一种洒圣水的帚),由于该类真菌常存在

版社,1973

[4] 裘维蕃,余永年主编.菌物学大全.北京:科学出版社,1998[5] 王家俊.临床真菌检验.上海:上海医科大学出版社,1995[6] 秦启贤.临床真菌学.上海:复旦大学出版社,2001

[7] 裘维蕃.关于真菌和菌物译名的真实涵义.植物病理学报,

1997,27(1):122

[8] 徐同,葛起新.多界菌物系统.植物病理学报,1997,27(1):32

4

[9] 吴绍熙主编.现代医学真菌检验手册.北京:北京医科大学,

于我国和东南亚国家的曲子内,因而译为“曲霉属”;第二个词黄色,由Link于1809年命名。又如

焦曲霉[Aspergillusustus(Bain)ThometChurch],括号内的Bain是首次命名人,括号后面的人是修改后的命名人。有时发现一种真菌具有某一明显而稳定的特征与模式种不同,这时可将其定为某个变种。学名可按“三名法”构成。如柱黄曲霉(或黄曲霉柱头变种)(Aspergillusflavusvar.columnaris)。此外,当某个或某些真菌只知其属名,而其种名加词未确定时,那么其种名加词可用sp.或spp.表示。如Aspergillussp.即表示一种曲霉,同样,Aspergillus

中国协和医科大学联合出版社,1998

[10] HawksworthDL,KirkPM,SuttonBCetal.AinsworthandBis2

by’sDictionaryoftheFungi.8thEd.Cambrage:CABInterna2tional,1995.

[11] KirkPM,CannonPF,DavidJCetal.AinsworthandBisby’s

DictionaryoftheFungi.9thEd.Wallingford:CABInternation2al,2001.

[收稿日期] 2005212230[本文编辑] 陈云光

范文十:真菌的分类与命名 投稿:武腉腊

主国真菌堂苤圭!!!!生!旦筮!鲞筮!翅堡也!』丛!!!!:!!!翌!翌!!!!:y!!!:堕!:!

・继续教育・

真菌的分类与命名

徐德强

肖义平

(复旦大学生命科学学院,上海200433)

【关键词】真菌;分类;命名【中图分类号】

R372

【文献标识码】

【文章编号】1673—3827(2006)01—0054-03

真菌(TrueFungi,即狭义的Fungi)是菌物(即广义的Fungi)中主要菌群,通常是指具有真正的细胞核、产生孢子和不含叶绿素,以腐生、寄生、共生或超寄生(superparasitic)方式吸收养料,仅少数为单细胞,其他都有分支或不分支的丝状体,细胞壁含有几丁质和葡聚糖,能进行有性和(或)无性繁殖,产生的孢子大多数无鞭毛,当有鞭毛时也无鞭茸毛,且分布十分广泛的一群细胞生物。它们与人类关系密切。其中许多真菌对人类是有益的,如可被用于抗生素、酶制剂、有机酸等生产,另一些还可被用于环境污染治理、植物病虫害的防治等。此外,还有些真菌可侵犯动、植物及人类,引起各种真菌病(Mycosis)等。1真菌的分类

真菌早在几千年前就被人类认识和利用,但对真菌的系统研究仅有200多年的历史。自1729年Michei首次对真菌(现在称作菌物,即广义的Fun—gi)进行分类以来,有代表性的真菌分类系统不下10多个。如DeBary(1884)、Martin等(1950)、Whir—taker(1969)、Margulis(1974)、Alexopoulos(1979)、Kendfick(1992)、Alexopoulos&Mins(1996)、Ain・sworth等(1973,1983,1995,2001)等的分类系统等。前期得到学术界较广泛采用的是Ainsworth等(1973)的分类系统,该系统主要依据营养方式、胞壁成分和形态特点将真菌分为黏菌门和真菌门,后者又分为5个亚门、18纲、66目、244科(见图1)。

根据近年来超微结构、生物化学及分子生物学的研究,已经明确过去所称的真菌(即广义的Fun.gi)是多元起源和演化的,尤其是其中的卵菌,其细

胞壁的主要成分是纤维素,细胞为双倍体,具有鞭茸毛的鞭毛,GC含量高于接合菌。此外,其rDNA序列也和真菌(TrueFungi,即狭义的Fungi)有差异,表明卵菌是不属于真菌的另一个类群。越来越多的研究表明,黏菌和卵菌在生物演化的早期都与真菌有所分化。在现代的生物八界系统(Cavalier.Smith,1988一1989)中,它们均属于和真菌不同的界

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丝孢纲(HyphoInycetes)、腔孢纲(coelomycetes)

作者简介:徐德强(1951一),男(汉族),副教授.E-mail:dqxu@fu-

dan.edu.en

Fig.1

图1

Ainsworth等(1973)分类系统图

fungi(1973)

Ainsworth’Sclassificationsystemof

万方数据

空国真菌堂盘查!!Q!生!旦筮!鲞筮!翅垦丛!』丛!型:£!!型!型!!!!:y尘!:盟!:!

・55・

[卵菌和黏菌分别归人假菌界(KingdomChromista)和原生动物界(KingdomProtozoa)]。

此外,《安・贝氏菌物词典》第8版(Ainsworth

andBisby§Dictionaryofthefungi,eighth

edition,1995)

和第9版(2001)也均将以往所称的真菌(广义的Fun-gi,即菌物)列入真核生物域(DomainEukaryota)的3个界,即真菌界、原生动物界和假菌界。其中,第9版(2001)中,真菌界包括4门和1类(见图2)。

其中壶菌门菌体为单细胞、单细胞具须或无隔多核、分枝菌丝体,细胞壁为几丁质(至少在菌丝阶段)。无性阶段产生具1根后生尾鞭式鞭毛的游动孢子(罕见多鞭毛),有性阶段可形成休眠孢子、休眠孢子囊或卵孢子。接合菌门菌体绝大多数为发达菌丝体或虫菌体,菌丝体大多无隔多核,细胞壁由几丁质和壳聚质组成。无性阶段主要产生孢囊孢子,有性阶段产生接合孢子。子囊菌门菌体丝状,有隔,少数为单细胞,细胞壁为几丁质。无性阶段常产生分生孢子,有的产生厚垣孢子,有性阶段产生子囊孢子。担子菌门菌体丝状、有隔,大多有锁状联合。无性阶段产生分生孢子、节孢子或粉孢子等,有性阶段产生担孢子。无性型真菌类菌体大多为有隔菌丝体,少数为单细胞。无性阶段主要产生分生孢子,有性阶段缺乏或未发现。

壶菌门包括2纲+、6目、17科、123属、914种

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图2

Ainsworth等真菌分类系统图(2001)

Fig.2

Ainsworth’sclassification

systemof

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fungi(2001、

方数据(《安・贝氏菌物词典》第9版,2001)。

真菌界中与医学关系密切的为接合菌门、子囊菌门及无性型真菌类,此外,担子菌门中也有少数种类与之有关。

接合菌门包括3纲+、15目、38科、181属,约1090种(第9版,2001)。本门中的人类致病菌主要存在于接合菌纲毛霉目(Mucorales)中。其中毛霉科(Mucoraceae)、瓶霉科(Saksenaeaceae)、小克银汉霉科(Cunninghamellaceae)和共头霉科(Syncephalas.traceae)中的一些种,引起人的接合菌病(Zygomyco.psis)。此外,接合菌纲虫霉目(Entomophthorales)中也有少数人类致病菌,如该目中的虫霉科(Ento.mophthoraceae)中的裂孢蛙粪霉(Basidiobolusranarum)等菌种可引起人类的皮肤病。

子囊菌门包括7纲+、56目、226科、3409属、

32

739种(第9版,2001)。与人类致病有关的真菌

有内孢霉科(Endomycetaceae)和酵母科(Saccharo.mycetaceae)中酵母属(Saccharomyces)的少数种。此外,裸囊菌科(Gymnoascaceae)和散囊菌科(Eu.rotiaceae)中也有一些人类致病菌,如皮炎芽生菌(Blastomycesdermatitidis)的有性期,皮炎阿耶罗菌(Ajellomyces

dermatitidis);组织胞浆菌

(Histoplastoma)的有性期,伊蒙菌(Emnoniella);小孢子菌(Microsporum)和毛癣菌(Trichophyton)的有性期,节皮菌(Arthroderma);构巢曲霉(Aspergillusnidulans)的有性期,构巢裸壳胞菌(Emericellanidulans)。另外,还有假性阿利什霉’

(Pseudallescheria)及毛结节菌(Piedraia)等。

担子菌门包括4纲+、33目、130科、1353属、

29

914种(第9版,2001)。人类致病菌主要为新生

隐球菌(Cryptococcusneoformans)的有性期,即新生拟线黑粉菌(Filobasidiellaneoformans)。

无性型真菌类包括不具有或尚未发现有性阶段的真菌(即以往称为半知菌、不完全菌或有丝分裂孢子真菌等)。第9版(2001)仍接受传统分类

中该类真菌的3个形态菌群[即过去所称的丝孢纲(Hyphomycetes)、腔孢纲(Coelomyeetes)和无孢纲(Agonomycetes)],但不作为正式分类单位。目前本类真菌共包括2600属,15000种+。致病菌有隐球菌属、念珠菌属(Condida)、红酵母属

注:+《安・贝氏菌物词典》第9版(2001)中,真菌各门提及的纲

中,有些纲未被最终接受,见真菌界4门l类划分情况。此外第9版中无性型真菌类未介绍属数和种数,上述所列数据来自第8版(1995)。

・56・

虫国真菌堂盘查!!!!生!旦筮!鲞筮!翅£!也』丛z!!!:!!!型!型!Q!!:y!!!:丛!:!

(Rhodotorula)、毛孢子菌属(Trichosporon,即丝孢酵母属)、曲霉属、青霉属(Penicillium)、芽生菌属、球孢子菌属(Coccidioides)、组织胞浆菌属、着色霉属(Fonsecaea)、表皮癣菌属(Epidermophton)、枝顶孢属(Acremonium)、小孢子菌属、毛癣菌属、副球孢子菌属(Paracoccidioides)、孢子丝菌属(Sporothrix)、瓶霉属(Phialophora)、外瓶霉属(Exophiala)、枝孢霉属(Cladosporium)、喙枝孢属(RhinocladieUa)和维朗那霉属(Veronaea)等。此外还有一些条件致病菌。真菌的命名也同样采用生物学中一贯沿用的以“双名制”为基础的国际植物学命名法。双名制是瑞典植物学家Linneaus(1753年)创立。生物的双名制的名字就是所谓的学名。一种真菌的学名是用拉丁词或拉丁化的词构成。第一个词是属名,通常用拉丁文的名词,属名第一个字母必须大写。第二个词是种名加词(或种的加词),一般是形容

词,字首一律小写。最后加上命名人的姓和命名年份(一般使用时,命名人的姓和命名年份可省略)。

在出版物中,真菌学名应排成斜体字,在书写时,应在学名之下划一横线,以表示它应是斜体字母。

真菌的属名和种名加词往往是指产生孢子的方式,孢子的特点、菌落颜色或质地、气味或其他较显著的特征。此外,有些真菌的属名或种名加词用以对某真菌学家表示敬意,将其姓定为种名加词或属名。也有种名加词是由地方名称衍生而来或指生存场所。另再有一些寄生真菌的种名加词来自寄主植物的属名。下面举例说明:黄曲霉(Aspergillusflavus

Link

1809),第一个词曲霉属

(原意是一种洒圣水的帚),由于该类真菌常存在于我国和东南亚国家的曲子内,因而译为“曲霉属”;第二个词黄色,由Link于1809。年命名。又如焦曲霉[Aspergillusustus(Bain)Thorn

et

Church],

括号内的Bain是首次命名人,括号后面的人是修

改后的命名人。有时发现一种真菌具有某一明显

而稳定的特征与模式种不同,这时可将其定为某个变种。学名可按“三名法”构成。如柱黄曲霉(或黄曲霉柱头变种)(Aspergillusflavusvar.columnaris)。此外,当某个或某些真菌只知其属名,而其种名加词未确定时,那么其种名加词可用sp.或spp.表示。如Aspergillussp.即表示一种曲霉,同样,Aspergillus

方数据spp.表示若干种曲霉。发表新种或新变种时,其学名后加上sp.nov.或var.nov.

国际命名法规定,一种真菌只能有一个属名和种名加词。如果一种真菌的生活史中具有性和无性阶段,则按有性阶段所起的名称是合法的。无性型真菌(半知菌)当只知其无性阶段时,它们的命名可根据无性阶段的特征而定,一旦发现其有性阶段时,正规的名称应该是有性阶段的名称。但有些真菌在整个生活史中,经常出现无性阶段,另偶尔也产生有性阶段,因此仍用其无性阶段的名称,如曲霉属、青霉属及小孢子菌属等均为无性阶段的名此外,为了保证“名称”有精确、能为大家所了时,不论用何种文字发表,必须附有适当的拉丁文在真菌分类中所应用的分类单位和其他生物中应用的一样,即域、界、门、亚门、纲、亚纲、目、亚目、科、亚科、属、种,其中属以上的单位都有一定的词尾。如门:-mycota;亚门:一mycotina;纲:一mycetes;亚纲:mycetidae;目:一ales;亚目:-ineae;科:-aceae;亚科:一oideae。属以下一般无固定的词尾。种下又可分为亚种、变种、亚型、专化型和生理小种等。

参考文献

[1]张纪忠主编.微生物分类学.上海:复旦大学出版社,1990[2]邢来君,李明春.普通真菌学.北京:高等教育出版社,1999[3]

中国科学院微生物研究所.常见与常用真菌.北京:科学出版社,1973

[4]裘维蕃,余永年主编.菌物学大全.北京:科学出版社,1998[5]王家俊.临床真菌检验.上海:上海医科大学出版社,1995[6]秦启贤.临床真菌学.上海:复旦大学出版社,2001

[7]

裘维蕃.关于真菌和菌物译名的真实涵义.植物病理学报,

1997,27(1):1—2

[8]

徐同,葛起新.多界菌物系统.植物病理学报,1997,27(1):3—

[9]吴绍熙主编.现代医学真菌检验手册.北京:北京医科大学,中国协和医科大学联合出版社,1998

[10]HawksworthDL,KirkPM,SuttonBC

et

a1.AinsworthandBis-

by’sDictionaryof

theFungi.8thEd.Cambrage:CAB

Interna—

tional,1995.

[11]

KirkPM,CannonPF,Davidjc

eta1.Ainsworthand

Bisby’S

Dictionary

oftheFungi.9thEd.Wallingfordj

CABInternation—

al,2001.

[收稿日期]2005—12_30

[本文编辑]

陈云光

2真菌的命名

称。

解的意义,命名法还规定凡报告一个新的属或种特征集要。

真菌的分类与命名

作者:作者单位:刊名:英文刊名:年,卷(期):被引用次数:

徐德强, 肖义平

复旦大学生命科学学院,上海,200433中国真菌学杂志

CHINESE JOURNAL OF MYCOLOGY2006,1(1)0次

参考文献(12条)

1.张纪忠.黄静娟.盛宗斗 微生物分类学 19902.邢来君.李明春 普通真菌学 1999

3.中国科学院微生物研究所 常见与常用真菌 19734.裘维蕃.余永年 菌物学大全 19985.王家俊 临床真菌检验 19956.秦启贤 临床真菌学 2001

7.裘维蕃 关于真菌和菌物译名的真实涵义 1997(01)8.徐同.葛起新 多界菌物系统 1997(01)

9.吴绍熙.吕桂霞.刘维达 现代医学真菌检验手册 1998

10.Hawksworth DL.Kirk PM.Sutton BC Ainsworth and Bisby's Dictionary of the Fungi 199511.Kirk PM.Cannon PF.David JC Ainsworth and Bisby's Dictionary of the Fungi 200112.安·贝氏菌物词典 2001

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从辽宁、黑龙江、吉林、山东、山西、河北、北京6省1市21个地区的大豆田中采集根际土样,采用直接分离法,卵悬液分离法,盖玻片法,滤纸片法,从大豆胞囊线虫胞囊上分离到生防真菌331株.对331株生防真菌进行胞囊寄生性测定,其中248株真菌的寄生率小于60%,占菌株总数的74%;85株真菌的寄生率大于60%,占菌株总数的26%.同时,研究了40株真菌发酵液对大豆胞囊线虫J2选择毒性作用.处理12h后,23株真菌的发酵液对J2致死率达到50%以上.结果表明真菌对胞囊的寄生能力与其发酵液对J2的毒性作用相关性不大.对寄生率大于60%的85株真菌菌株进行了系统的分类鉴定,鉴定出10属17种真菌(其中包括2个未定种).Monocillium mucidum为国内新记录种.菌落初期白色,后为土黄色,菌落呈干燥的毛刺状,边缘色浅,晕圈状,背面淡黄褐色.分生孢子梗14.0μm~23.5μm×1.5μm~2.5μm,产生于菌丝上,单生,偶有分枝,梗基部常产生一个分隔.瓶形分生孢子梗,壁基部明显加厚.分生孢子

3.1μm~4.5μm×2.3μm~3.5μm,卵圆形、柠檬形.在PSA培养基上可以产生大量各种形状的晶状体,多为棒状、立方体,另有三角形、梯形、不规则形等.拟炭角镰孢(F. xylarioides),Monocillium mucidum和绳状青霉(P.funiculosum)为世界首次报道分离自大豆胞囊线虫胞囊上的生防真菌;半裸镰孢(F.semitectum),拟炭角镰孢(F. xylarioides),M. mucidum,绳状青霉(P.funiculosum),链孢粘帚霉(G.catenulatum),粉红粘帚霉(G.roseum),粘帚霉未定种(G.sp.)均为国内首次报道分离于大豆胞囊线虫胞囊上的生防真菌.从筛选出的胞囊寄生真菌中,选出三株常用于生物防治的菌株:淡紫拟青霉(P.

lilacinus),厚垣轮枝菌(V.chlamydosporium)和粘帚霉未定种(G.sp.),及一株在胞囊上分离频率较高的镰刀菌:茄病镰刀菌(F. solani).对这四株真菌进行温室防效试验. 该研究丰富了中国大豆胞囊线虫生防真菌资源,为中国大豆胞囊线虫生物防治奠定了理论基础.

3.会议论文 陈健斌 中国大陆出版物中真菌新分类单位新组合名称汇总1985-1989 19904.学位论文 潘好芹 长江、黄河源头地区土壤中暗色丝孢菌物种多样性研究 2009

土壤真菌是指以土壤作为活动场所完成全部或部分生活史的真菌,在土壤生态系统中发挥巨大作用,具有丰富的多样性。长江、黄河源头地区地处青藏高原腹地,自然环境极其严酷,主要表现在两个方面:一是高海拔,低气温,干旱;二是低植被,生态效能低。其特殊的地理条件蕴育了极其脆弱而低转化状态的高寒干旱的生态系统,特殊的生态环境蕴育了该地区特殊的土壤真菌物种多样性。

本研究是我国土壤暗色丝孢真菌多样性研究的一部分,着重考察长江、黄河源头地区土壤中的暗色丝孢真菌及其生态分布特点,了解该地区土壤真菌种类,进一步丰富我国生物多样性方面的知识,为相关研究和真菌资源开发利用奠定基础。长期以来无性态真菌(Anamorphic Fungi)的分类主要以形态特征为根据,分类的依据主要包括:载孢体的类型(如载孢体菌丝状、孢梗束状、瘤座状、分生孢子器状等)、分生孢子的形态(包括单胞孢子、双胞孢子、多隔孢、砖格孢、线形孢、卷旋孢、星状孢)及分生孢子的形成方式与产孢梗(细胞)的延伸方式(如体生式、芽生式等)。本论文以自己分离到的34属暗色丝孢真菌为实材,在传统形态分类的基础上,进行ITS-rDNA序列分析,以丰富对无性态真菌分类信息的认识,探索此类真菌属、种级形态分类标准的分子依据。同时,对本实验室积累菌株较多的矛束霉属、毛束霉属和粘束孢属等三属真菌的代表性种,进行若干基因片段的分子生物学测定,为属的界定及属下种的划分,在形态分类的基础上寻求新的分子生物学分类标准。

笔者等先后于2006-2007两年,从长江、黄河源头地区采集混合土壤样品200份,涉及的生境类型包括:森林、草原、农田、戈壁、沙漠、荒地、湿地、高山草甸等八类。采用稀释平板法、土壤平板法等分离培养,共获得700多个菌株。从中鉴定出暗色丝孢真菌35属,92种。其中,新种17个,新组合1个,中国新纪录种8个。所研究的属、种均作详细形态描述和分布地点、生境引证。对有关属、种级分类地位的变迁、范畴、分类标准等分类问题,主要是相似属、种之间的区别进行了简要讨论。

一、暗色丝孢真菌物种多样性

新种:球孢矛束霉、到达漆斑霉土壤变种 、青海卷旋孢、大孢单格孢 、黄河单格孢、多变粉枝孢、矮小侧多格孢、多变小鼻枝霉、中华齿梗孢、光滑齿梗孢、长孢齿梗孢、土生帚霉、青霉状帚霉、刺突帚霉、长孢葡萄穗霉、小孢短梗蠕孢、戈壁维罗纳霉、圆孢维罗纳霉。 未定名种(七个):枝顶孢属Acremonium sp.、头梗霉属Cephaliophora sp.、枝孢属Cladosporium sp.、帚霉属Scopulariopsissp.1,Scopulariopsis sp.2、轮枝孢属Verticilliumsp.、沃德霉属 Wardomyces sp.。

中国新纪录种(八个):花菱草顶孢Acroconidiella eschscholtziae(Harkn.) M.B.Ellis、棉絮状葡萄孢Botrytis byssoidea Walker、膨梗粘鞭霉Gliomastix inflate(C.H.Dickinson)W.Gams,、树状齿梗孢 Scolecobasidium dendroides Pirozynski& Hodges、冬眠帚霉Scopulariopsis hibernicaA.Mangan、喜粪维罗纳霉 Veronaea coprophila(Subram.&Lodha)M.B.Ellis、异形沃德霉Wardomyces anomalus Brooks& Hansf.、土生沃德霉Wardomyceshumicola Hennebert& G.L.Barron。

其余为国内已知种。所有研究过的分离物标本(干制培养物)与活菌种均保存在山东农业大学植物病理学标本室(HSAUP)。

在分类研究的基础上,以物种丰富度、种群优势度、Shannon-Wiener多样性指数、群落均匀度、生态位宽度及生态位重叠指数等为衡量指标,对黄河源头地区土壤中的暗色丝孢真菌物种多样性及其与生态类型间的相互关系进行了初步分析。研究发现,暗色丝孢真菌在不同生态类型中的数量和分布特征差异明显。不同生态类型中的优势物种(属级)不同,物种多样性与植被密切相关。植被丰富的森林、草原生境中,暗色丝孢真菌物种多样性明显高于植被稀疏的戈壁、沙漠。相对于我国土壤暗色丝孢真菌多样性考察研究中对低海拔地区的研究结果,长江、黄河源头地区的土壤暗色丝孢真菌物种数量显著较少,蠕形分生孢子真菌等大孢子无性态真菌种类较少,而小孢子物种相对较多。 二、分离方法的改进

暗色丝孢真菌人工培养常用的培养基有PDA,PCA,CMA,TWA+W等;培养条件一般为25℃,12h光照/12h黑暗,培养1~3周(培养时间根据不同的属、种产孢及孢子成熟所需时间的长短而定)。笔者根据土壤样品采集地点的高海拔、低气温特点,适当降低了培养温度,把培养温度调整到18℃,并根据每个样品土壤类型,在培养基中适当加入了原产地土壤浸出液,从而大大提高了分离效果。此外,机械损伤、适当的低温刺激等处理,有利于促进暗色丝孢真菌的产孢。

三、基于5.8S rDNA-ITS序列的属级分类检索表分析

通过5.8S rDNA-ITS序列分析,用Neighboring-joining方法对论文中涉及的32属构建系统发育树。除若干对相似属,如:矛束霉属与毛束霉属、粘鞭霉属与枝顶孢属、侧,多格孢属与维罗纳霉属、顶孢属与弯孢属序列相似性为98%-100%外,其余各属均能在较明确遗传距离处完全分开。说明5.8SrDNA-ITS序列分析对土壤暗色丝孢真菌属级分类很有价值。特别是5.8S rDNA-ITS序列能够较好的反映出无性态真菌形态分类中,芽生式产孢这一属级分类标准,而对体生式产孢的特性,则未能明确地反映。全壁芽生式和内壁芽生式在系统发育树中明确划分,产孢方式为全壁芽生式的沃德霉属、矛束霉属、毛束霉属等聚为一支。同时系统发育树也能够很好的区分内壁芽生瓶梗式和内壁芽生孔生式的真菌。但也存在少数例外,产孢方式为全壁芽生和内壁芽生的个别属在聚类系统树中序列相似性较高,需要进一步的实验来求得合理的解释。

四、对矛束霉属Doratomyces、毛束霉属Trichurus、粘束孢属Graphium代表性种,进行5.8S rDNA-ITS序列分析和mt-SSU基因序列分析,用

Neighboring-joining方法构建聚类系统树的结果表明,粘鞭霉属Graphium能与其他两供试属明确区分,而矛束霉属Doratomyces和毛束霉属Trichurus供试菌株之间的5.8S rDNA-ITS序列相似性及mt-SSU基因序列相似性均达到97%-100%,两个片段序列在矛束霉属Doratomyces和毛束霉属Trichurus中具有高度保守性,不仅不能在属级水平上分开,在形态上差异显著的种间也不能进行区分。这一结果支持将矛束霉属和毛束霉属合并的观点。粘鞭霉属各供试菌株之间,通过5.8S rDNA-ITS序列比对构建系统发育树,可以划分为3个进化支,明确划分出拜迪粘束孢Graphium dubautiae,其他种间的界线不明显。在据mt-SSU基因序列构建的聚类系统树上,Graphium属内8个供试菌株被划分为4个进化支,进化支之间序列相似性仅为63%-94%,而同分支内各菌株之间序列相似性均为100%。分析结果与5.8S rDNA-ITS序列分析结果稍有差异,这可能与5.8S rDNA-ITS序列同mt-SSU基因序列进化速率不一致相关。由于5.8S rDNA-ITS序列和mt-SSU基因序列在三属内的高度保守性,由其构建的系统发育树未能将供试的属、种进行有效区分,预示仅通过这两个基因片段对矛束霉属、毛束霉属和粘束孢属及以下分类单位进行区分是不充分的,需要借助多基因分析手段才能真正明确供试属、种正确的分类地位。

5.会议论文 汪碧涵.王燕婷.张静文.锺成晏.林益异.葉瑩 核酸技術在腐霉屬真菌分類、鑑定與偵測之应用 2001

腐毒菌属(Pythium Pringsh)的真菌是最重要的植物病原菌之一,多数菌种为廣寄主病原菌,引起植物嚴重病害;有些菌种则为隐性病原菌

(subclinical pathogens),在植物根圈生长,并不导致病微,却降低植物生长力,Pythium的分类和确定以其形熊造構造特微为依据.目前许多核酸方面的研究,让我们对Pythium有更多的认识,粒腺體DNA兴核醣體DNA序列的分析,发现无性世代游孢囊的形熊是重要的分类特微,应可做Pythium亚属的分类依据,对现在使用的Plaats-niterink的分类检索表造成一些行动;许多Pythium菌种有导一笥粒腺體DNA兴核醣體DNAITS序列的RFLP回谱,可以应用在菌种定上.因此,本文简介Pythium属真蓖近年在菌种分类、定兴病原菌侦测上,以核酸为基础的一些研究.

6.期刊论文 冯帆.屈飞 真菌的分类、价值与利用 -陕西师范大学继续教育学报2003,20(3)

真菌是广泛分布于世界各地的一大类真核微生物.真菌种类繁多,总数在十万种以上.人们对真菌的认识不断深入,许多种真菌已在人们的生活中发挥了重要作用.本文将对真菌及相关的问题进行综述.

7.学位论文 王冬梅 嗜热真菌分类及嗜热子囊菌光孢变种内切β-葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶的分离纯化及特性研究

2005

嗜热真菌在高温条件下具有独特的生存适应能力,产生嗜热酶等特殊的代谢产物,是研究生物进化和热稳定酶的重要微生物来源。本研究的第一部分主要是进行了中国嗜热真菌的分类研究。从2002-2004年本实验室采集的600多份标本中共分离鉴定到嗜热真菌15种,其中,新种1个,中国新记录种9个,中国已报道种4个,不确定种1个,另外还分离鉴定了4种耐热真菌。本研究较全面、系统地对嗜热真菌进行了考察、收集、分离、鉴定和形态描述,并分别对每个种的基质、生境及分布等做了统计,对相似的种间进行了比较和讨论。在前人工作的基础上,增加了新种及若干新记录种,总结出比较简便易行的种级分类标准和我们自己的分类观点。孢子的特征(包括形状、大小、颜色、隔膜数和表面纹饰等)是种级分类的主要依据,一些形态差异较大的孢子可作为属的划分标准;其次,分生孢子梗的形态特征、产孢细胞的延伸方式及产孢方式也是主要的鉴别依据,对属级水平上该真菌的鉴别有重要意义;另外,培养特征及产孢表型可作为分类鉴定的必要、有益补充。嗜热子囊菌光孢变种在45~50℃高温下生长旺盛,产生的纤维素酶在高温条件下保持较高的活力和热稳定性。本研究的第二部分主要是探讨了该嗜热真菌产生的内切β-葡聚糖酶与β-葡萄糖苷酶的分离纯化及特性研究。

8.期刊论文 赵国柱.张天宇.厉云 暗色砖格丝分孢子真菌的分类问题 -山东农业大学学报(自然科学版)2001,32(4)

暗色砖格丝分孢子真菌(Dematiaceous dictyo-mitosporic fungi)是指分生孢子具有纵、横膈膜的暗色,以有丝分裂方式产生孢子的真菌,属丝孢纲(Hyphomycetes),是经济上非常重要的真菌类群之一.目前发现的这一类群真菌主要包括:链格孢(Alternaria Nees)、埃里砖格孢(Embellisia

E.G.Simmons)、顶茁格孢(Gibbage E.G.Simmons)、假格孢(Nimbya E.G.Simmons)、匍柄霉(Stemphylium Wallr.)、单格孢(Ulocladium Preuss)、附球霉(Epicoccum Link)、密格孢(Acrodictys M.B.Ellis)、Sirosporium Bubak&Serebrian、Pithomyces Berk.&Broome、Moncdictys Hughes、

Berkleasrmium Zobel、Sclerographium Berk.等属,具有丝孢纲真菌的主要特征:分生孢子不产生在分生孢子盘和分生孢子器内,分生孢子梗散生、束生或着生在分生孢子座上.

9.学位论文 赵嘉平 树木溃疡病菌——葡萄座腔菌属及相关真菌系统分类研究 2007

葡萄座腔菌属(Botryosphaeria)多种真菌及相关无性型是引起杨树溃疡病,松树枯梢病,苹果、梨树等果树轮纹、干腐病,桉树溃疡病等多种树木枝干溃疡的致病真菌。Botryosphaeria是在子座或假囊壳型囊实体中产生双囊壁子囊的真菌的总称。由于真菌的有性型形态特征极其相似

,Botryosphaeria属真菌的分类主要依据无性型的形态学及培养学特征。但是由于在历史上相关真菌名称、分类地位多次变更,具有众多形态各异的无性型,以及无性型与有性型不对应等原因,Botryosphaeria属真菌分类一直存在很多矛盾与争议。因此,作为一种主要的树木病原真菌,Botryosphaeria的系统分类具有重大的生物学及病理学意义。

本研究以在我国17个省(区、市)、34个县(市),19科,31个属,59个种、品种或无性系的寄主植物上分离到的158株Botryospaheria及其相关真菌为材料,根据培养学特征、生长速率特征、形态学特征对试验菌株进行了分类鉴定:收集GenBank中全部Botryosphaeria及其相关真菌的rDNA-ITS、β-mbulin及EF1α基因序列,对于Botryospaheria及相关真菌的系统发育地位重新进行了分析;应用RAPD、ISSR分子标记研究了Botryospaheria及其相关真菌的相互关系及遗传分化;依据本研究获得的53条rDNA-ITS~LSU序列,35条β-tubulin基因,对我国部分地区的Botryospaheria及其相关真菌的系统发

育进行了研究。主要研究结果如下:

1.通过对于我国树木病害病原研究的分析,初步确定樱花(Prunus serrulata Lindl.)、大豆樱(Prunus incisa C.P.Thunberg ex

A.Murray)、蟠桃 (Amygdalus persicaL.var.compressa(Loud.)Yü et Lu)、阴香(Cinnamomum burmannii(C G et Th Nees)Bl.)、柑桔(Citrusreticulate Blanco)、水蒲~(Syzygiumjambos(L.)Alston)、大花五桠果(Dilleniaturbinata Finet et Gagnep)、诃子(Terminalia chebula

Retz.)、红花羊蹄甲(Bauhinia blakeanaDunn)、散尾葵(Chrysalidocarpus lutescens H.Wendl.)、八角(Illicium velum Hook.f.)、南洋楹(Albiziafalcataria(L.)Fosberg)、滇青冈(Cyclobalanopsis glaucoides Schotky)、水冬瓜(Aluns cremastogyne Burkill)、桦树(Bemla spp.)等14属,15种植物是Botryosphaeria及相关真菌的新的寄主植物类型。

2.根据PDA培养基上的菌落特征和不同温度下的生长速率特征,将Botryospaheria及相关真菌分为7个主要类群;对其中的22个菌株的子实体特征(结构、壁的类型、产分生孢子细胞和分生孢子的形态、大小、颜色、分隔、分生孢子的产生方式、分生孢子的发育变化特征等)进行了详细描述;依据菌落特征、生长速率以及子实体特征,将试验菌株确定为B.dothidea、B.rhodina、B.parva、B.obmsa、B.stevensii、B.eucalyptorum、Fusicoccum mangiferum、Diplodiapinea等8个形态学种。

3.应用GenBank中rDNA-ITS、β-tubulin及EF1α基因序列,对Botryospaheria相关真菌的系统分类地位进行了分析,研究表明,GenBank中的Botryosphaeria真菌可以分为5个紧密相关的单系类群,这些类群和Fusicoccum、Dothiorella、Neofusicoccum、Macrophomina属以及

Diplodia/Lasiodiplodia复合体相对应。序列分析显示Diplodia与Lasiodiplodia之间也有显著的分子差异,因此,传统意义上Botryospaheria真菌可以认为是由这6个属构成的属的复合体。

4.RAPD/ISSR聚类分析明确解析出B.dothidea、B.rhodina、B.parva、B.obmsa、B.stevensii、D.pinea等真菌的差异;B.dothidea分化为两个类群Ⅰ、类群Ⅲ,主要以蔷薇科多种植物为寄主的类群Ⅲ菌株(CXY120、CXY134等14个)具有截然不同的PCR扩增模式,分析表明,类群Ⅰ、Ⅲ的种内遗传距离大于类群Ⅰ与类群Ⅱ的种间遗传距离。

5.rDNA-LSU、rDNA-ITS及β-tubulin分析均将试验菌株归于Diplodia/Lasiodiplodia、Fusicoccum、Neofusicoccum属;LSU分析表明CXY616、CXY617、CXY611、CXY580、CXY585、CXY828共6个B.rhodina菌株构成一个具有99%自展支持度的单系类群;rDNA-ITS及β-tubulin分析表明形态学确定的B.rhodina真菌分化为紧密相关但截然不同的两个系统发育群,CXY585、CXY617等6个菌株和CXY576分别位于两个发育群中,由于没有观察到CXY585、CXY617等菌株与CXY576之间的明确地形态学差异,因此将其根据分子数据作为两个不同系统发育学种(phylogenetic species)RAPD/ISSR类群Ⅲ的B.dothidea菌株具有和其他的B.dothidea真菌相同的序列特征,但是由于培养特征、生长特性、寄主类型以及RAPD/ISSR扩增模式与典型的B.dothidea真菌明显不同,确定RAPD/ISSR类群Ⅲ菌株是B.dothidea真菌的蔷薇科植物寄主专化型:B.dothidea deNot.f.sp.rosacola。

10.期刊论文 谢艺贤.郑服丛 应用DNA分子进行真菌分类的原理及方法 -华南热带农业大学学报2000,6(1)

系统介绍现代分子生物技术RFLPs,PCR,RAPDs,ALFPs和SAPs技术在真菌分类上的价值以及在某些方面已取得的成就,并详细介绍其分类原理和操作方法.

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