氨基酸分子量_范文大全

氨基酸分子量

【范文精选】氨基酸分子量

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【专家解析】氨基酸分子量

【优秀范文】氨基酸分子量

范文一:氨基酸分子量 投稿:吴螓螔

Mol.wt. Hydro- Hydro- pKa Accessible

Amino acid

甘氨酸-----Gly-----G 干gan了le的叶ye子

丙氨酸-----Ala-----A 一个夹心饼干(把A想成一片饼干,两面都是A,中间加点东西)

缬氨酸-----Val-----V 缬读xie,和腹泻的泻同音!四川人管上厕所叫窝(Val)屎

亮氨酸-----Leu-----L 亮的英语单词是light

异亮氨酸---Ile----I 把I想成一

苯丙氨酸---Phe----F 他(he)人又苯,又爱放屁(P),我真的服(F)了他了

脯氨酸-----Pro----P 胸脯(p)肉(ro)

色氨酸-----Trp----W 我w喜欢看三three个人ren日屁股p,我太色了

丝氨酸-----Ser----S S的读音

酪氨酸-----Tyr----Y 踢T你的your鸭儿r,让你变成懦夫

半胱氨酸---Cys----C 这个来自一个单词Cyst,是膀胱的意思。读音和妹妹差不多。妹妹的膀胱

蛋氨酸-----Met----M 小的时候,妈妈M老是叫我吃eat鸡蛋

天冬氨酸---Asp----D 把As想成天冬。医生D说AS的尿是酸性的 天冬酰胺---Asn----N 不能在冬天制造血案

谷氨酰胺----Gln---Q 谷物没多少了,最大的问题在于可能发生血案 谷氨酸------Glu---E 谷物的益处E在于可以变成葡萄糖

苏氨酸------Thr---T 他TA喝he了瓶苏打水,终于不热re了 赖氨酸------Lys---K

性氨基酸)直

精氨酸------Arg---R

组氨酸------His---H 美国的国务卿耐丝LYS说她可以让台湾占山为王KING,老胡说,你简(碱是在放屁 大家都看过周星驰的电影,有一次,他喝了杯精液,观众就在争论argue喝的是不是热RE的精液 H想成医院,医院切掉了他的his病变组织

范文二:氨基酸分子量与种类 投稿:梁漅漆

缩写 中文译名 支链 分子量 酸碱度(50g/L溶液,25℃) 溶解度 参考价格(元/吨) Gly G 甘氨酸 亲水性 75.07 pH= 5.8 ~ 6.4 25g/100ml 17000-20000 Ala A 丙氨酸 疏水性 89.09 pH= 5.5~7.0 17g/100ml 28000 Ser S 丝氨酸 亲水性 105.09 pH= 5.5~6.5 38g/100ml 180000 Pro P 脯氨酸 疏水性 115.13 pH=5.9~6.9 154.56g/100ml 110000 Val V 缬氨酸 疏水性 117.15 pH=5.5~6.5 8.85g/100ml 110000 Thr T 苏氨酸 亲水性 119.12 pH=5.0~6.5 20g/100ml 28000 Cys C 半胱氨酸 亲水性 121.16 pH=4.5~5.0 0.011g/100ml 115000 Leu L 亮氨酸 疏水性 131.17 pH=5.5~6.5 2.5g/100ml 150000 Ile I 异亮氨酸 疏水性 131.17 pH= 5.5~6.5 4.03g/100ml 195000 Asn N 天冬酰胺 亲水性 132.12 pH= g/100ml 350000 Asp D 天冬氨酸 酸性 133.10 pH=2.0~4.0 g/100ml 100000 Lys K 赖氨酸 碱性 146.19 pH=5.5~6.0 63g/100ml 25000 Gln Q 谷氨酰胺 亲水性 146.15 pH= 98000 Glu E 谷氨酸 酸性 147.13 pH=6.8~7.0 0.00072 g/100ml 22500 Met M 甲硫氨酸 疏水性 149.21 pH=5.6~6.1 3.3g/100ml 24000 His H 组氨酸 碱性 155.16 pH=7.0~8.0 4.19 g/100ml 210000 Phe F 苯丙氨酸 疏水性 165.19 pH=5.4~6.0 0.05 g/100ml 80000 Arg R 精氨酸 碱性 174.20 pH=10.5~12.0 15 g/100ml 155000 Tyr Y 酪氨酸 疏水性 181.19 pH=5.5~6.5 0.04 g/100ml 120000 Trp W 色氨酸 疏水性 204.23 pH=5.5~6.5 1.1 g/100ml 280000

范文三:氨基酸分子量及解离常数测定 投稿:萧聀聁

实验六 氨基酸分子量及解离常数测定

实验目的

1.掌握酸度计的基本结构及操作。

2.掌握玻璃电极的基本结构、保存和是使用。

3.掌握缓冲溶液在测定溶液酸度上的应用。

4.掌握电位滴定曲线的绘制及滴定终点的确定方法。

5.掌握电位滴定在测定物质物理常数上的应用。

实验原理

玻璃电极属于以玻璃薄膜作为敏感膜的一类选择电极,可对溶液中的氢离子

产生选择性响应,其电极电位与被测氢离子浓度之间符合能斯特关系,可应用于氢离子浓度或溶液酸度值的测定。

本实验采用玻璃电极为指示电极,饱和甘汞电极为参比电极与被测溶液组成

电池,利用酸度计测定溶液酸度值,电池如下:

Ag∣AgCl(s),内参比溶液∣玻璃膜∣待测溶液∣∣KCl(饱和),Hg2Cl2(s)∣Hg

在构成的电池中,饱和甘汞电极的电极电位保持不变,玻璃电极的电极电位仅随

+待测液中的H浓度变化而变化,可表示如下: 2.303RT2.303RT E=K+lg[H+]=K-pH nFnF

谷氨酸是分子内含羧基的二元酸,其分子式为C5H9O4N,分子量为147.13,第二解

离常数很小,采用一般滴定分析不容易观察到滴定突跃。

在谷氨酸与NaOH溶液的滴定过程中,随着NaOH的不断加入,溶液中的H+浓度不断变化,由此引起的溶液的酸度值(电池的电动势)也不断变化,达到滴定化学计量点附近,将产生H离子浓度的突跃,从而可以根据溶液酸度值的变化确定滴定第一化学计量点,以此为根据,可推算谷氨酸与NaOH溶液滴定的第二化学计量点(V终点2=2V终点1),可根据反应摩尔比求出谷氨酸的分子量。

谷氨酸在水溶液中的电离平衡为:

[H][HA]H2A=HA+H Ka1==6.31×10-5………………① [H2A]-+ HA=A+H

-2-+ [H][A2]-10 Ka2==2.57×10[HA]

从中可以看出,当滴定进行到计量点的一半(即0.5V终点)时,溶液中[H2A]=[HA-],

代入①式,则看、Ka1=[H+],即pKa1=pH,因此只要确定滴定的终点,并在滴定曲线上找到0.5V终点所对应的pH,就可以求出谷氨酸的第一级解离常数;同理,在

滴定曲线上找到1.5V终点对应的pH,就可以求出谷氨酸的第二级解离常数,而根据谷氨酸与NaOH滴定至第一化学计量点时的反应摩尔比,就可以计算出谷氨酸的分子量。

实验仪器与试剂

1.pHS-3C型酸度计

2.NaOH标准溶液(0.1000mol/l)

3.E-201-CpH复合电极一只

4.系列标准缓冲液

5.磁力搅拌器一台

6.25ml移液管一只

7.100ml玻璃烧杯一个

实验步骤

1.滴定前准备:将酸度计调节于测定pH位,按照仪器操作程序分别用系列标准缓冲溶液完成仪器的校准。

2.滴定:取一个干净的100ml的玻璃烧杯,用移液管移25.00ml的谷氨酸标准溶液。将烧杯置于磁力搅拌器上,插入复合电极,按照下表滴加NaOH标准溶液,

1.以pH为纵坐标,以NaOH滴加的体积为横坐标制图,绘制滴定曲线。 2.采用作图法求出滴定的终点:在绘制的滴定曲线上,通过曲线上、下两个拐点处画出两条为45°角的切线,在两切线之间作一条垂线,再通过垂线的中点作一条平行于两切线的直线,该直线与滴定曲线的交点即为A点,A点在横坐标上对应的NaOH标准溶液的体积就是滴定终点,如图所示:

3.谷氨酸的分子量计算:

根据作图法得到的滴定终点体积值、NaOH标准溶液的浓度、谷氨酸的浓度和体积,采用下式计算谷氨酸的分子量:

谷氨酸的分子量=W谷氨酸(g/L)25.00 CNaOHV终点

由图可知V终点=11.80ml,谷氨酸的分子量=147.32

4.结果比较:

1.实验开始之前用标准缓冲溶液调节仪器的目的是将pH电极进行校准,采用两种不同pH标准缓冲溶液的目的是进行双点校准。

2.在溶液酸度测定中,测定的是溶液中氢离子的活度而非浓度。

3.酸度计使用之前的校准与标准液相差不大没有太大的关系,只是会成为系统

误差。PH复合电极使用前后都应该泡在电极缓冲液中。

4.酸度计的指数存在飘逸现象,应待读数稳定之后再读数,每次读数时间大致保持一致。

范文四:多肽合成---氨基酸分子量表 投稿:袁厽厾

cps029@chinapeptides.com

英文简写英文名AlanineCysteineAsparticacidGlutamicacidPhenylalanineGlycineHistidineIsoleucineLysineLeucineMethionineAsparagineProlineGlutamineArginineSerineThreonineValineTryptophanTyrosine

英文缩写AlaCys(Trt)Asp(But)Glu(But)PheGlyHis(Trt)IleLys(Boc)LeuMetAsn(Trt)ProGln(Trt)Arg(Pbf)Ser(But)Thr(But)ValTrp(Boc)Tyr(But)

中文名丙氨酸半胱氨酸天门冬氨酸谷氨酸苯丙氨酸甘氨酸组氨酸异亮氨酸赖氨酸亮氨酸

甲硫氨酸(蛋氨酸)

分子量89.1121.2133.1147.1165.275.1155.2131.2146.2131.2149.2132.1115.1146.2174.2105.1119.1117.1204.2181.2

分子量(带保护基)

311.38585.7411.46425.48387.4297.3619.7353.4468.55353.4371.5596.7337.4610.7648.77383.4397.5339.4526.5459.5

ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY

天门冬酰胺脯氨酸谷氨酰胺精氨酸丝氨酸苏氨酸缬氨酸色氨酸酪氨酸

亲水性氨基酸:D、E、H、K、Q、R、S、T、N疏水性氨基酸:A、F、I、

L、M、P、V、W、Y

碱性氨基酸:R、K、H带正电荷的氨基酸:K、R、H

酸性氨基酸:D、E带负电荷的氨基酸:D、E

茚三酮法检测显砖红色或无色:S、P、D、N

易被氧化的氨基酸:Y、W、C、M

范文五:氨基酸相对分子质量计算 投稿:高瘊瘋

1、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成一条多肽链,表示出该多肽链的相对分子质量 2、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成三条多肽链,三条多肽链构成蛋白质,表示出该蛋白质的相对分子 质量 3、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成产物如图,表示出该产物的相对分子质量

4、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成产物如图,表示出该产物的相对分子质量

5、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成产物如图,表示出该产物的相对分子质量

6、有 a 个氨基酸,平均分子质量为 n,这些氨基酸之间脱水缩合形 成环肽,表示出环肽的相对分子质量

范文六:氨基酸与密码子表 投稿:白燶燷

核苷酸链中除出现正常的A、T、G、C四种碱基符号外还出现如R、Y、M、K等其它字母(其中R=A/G,

Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W= A/T,H= A/C/T,B= C/G/T,V=A/C/G, D=A/G /T,N=A/C/G/T)。

表1 氨基酸中英文对照及缩写(来源于网络)

指的是人体

自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必必需氨基酸须从食物中摄取的氨基酸。它是人体(或其它脊椎动物)必不可少,而机体内又不有合成的,必须从食物中补充的氨基酸,称必需氨基酸。对成人来讲必需氨基酸共有八种:赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、

苏氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸。如果饮食中经常缺少上述氨基酸,可影响健康。它对婴儿的成长起着重要的作用。组氨酸为小儿生长发育期间的必需氨基酸,精氨酸、胱氨酸、酪氨酸、牛磺酸为早产儿所必需。

范文七:氨基酸与密码子表 投稿:罗讇讈

氨基酸是组成蛋白质的基本零件,蛋白质又是组成动物和人体内主要细胞、组织、器官的重要基础,是完成生命活动的主要功能行使者。下面我只是将生物体内常见的20种氨基酸的结构和中英文列在下表,仅仅供了解之用。世界上数以亿计中的蛋白质其本质都是有这些基本的氨基酸通过不同的排列组合形成的,在体内被合成(表达)以后通过不同的修饰,最后开始在体内行使其职责和使命。虽然蛋白质种类如此繁多,但是他们的合成却不是随意的,而是受到遗传和基因控制的。基因携带的遗传信息是可以稳定的通过繁殖不断的继承下来,从基因到蛋白,科学通过不懈努力终于发现了基因是如何指导蛋白质的体内合成。原来他们之间有一套完整的密码控制,一一对应,丝毫不差,因此才能合成出如此完美的蛋白质来。

表1 氨基酸中英文对照及缩写(来源于网络)

范文八:氨基酸密码子对照表 投稿:史礆礇

丙氨酸 Alanine A 或 Ala89.079 精氨酸 Arginine R 或 Arg174.188天冬酰胺 Asparagine N 或 Asn132.104天冬氨酸 Aspartic acid D 或 Asp133.089半胱氨酸 Cysteine

C 或 Cys121.145

CH 3 -

脂肪族类

HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 碱性氨基酸

- 类 H 2 N-CO-CH 2 - HOOC-CH 2 - HS-CH 2 -

H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 - HOOC-(CH 2 ) 2 - H-

N=CH-NH-CH=C-CH 2 - |__________|

CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - H 2 N-(CH 2 ) 4 - CH 3 -S-(CH 2 ) 2 - Phenyl-CH 2 - -N-(CH 2 ) 3 -CH- |_________| HO-CH 2 -

CH 3 -CH(OH)-

Phenyl-NH-CH=C-CH 2 - |___________|

4-OH-Phenyl-CH 2 - CH 3 -CH(CH 2 )-

酰胺类 酸性氨基酸类 含硫类 酰胺类 酸性氨基酸类 脂肪族类 碱性氨基酸类 脂肪族类 脂肪族类 碱性氨基酸类 含硫类 芳香族类 亚氨基酸 羟基类 羟基类 芳香族类 芳香族类 脂肪族类

谷氨酰胺 Glutamine Q 或 Gln146.131谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu

147.116

甘氨酸 Glycine G 或 Gly75.052 组氨酸 Histidine H 或 His异亮氨酸 Isoleucine I 或 Ile

155.141131.160

亮氨酸 Leucine L 或 Leu131.160赖氨酸 Lysine

K 或 Lys146.17

蛋氨酸 Methionine M 或 Met149.199苯丙氨酸 Phenylalanine F 或 Phe 165.177脯氨酸 Proline P 或 Pro 115.117丝氨酸 Serine

S 或 Ser

105.078

苏氨酸 Threonine T 或 Thr 119.105色氨酸 Tryptophan W 或 Trp204.213酪氨酸 Tyrosine Y 或 Tyr181.176缬氨酸 Valine

V 或 Val117.133

与核苷酸序列相关的特征关键词表 关键词 说明 allele

相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现有的序列(和或许其它序列)

attenuator 存在调节转录的终止的DNA区域,它控制了一些细菌操纵子的表达; (2)位于启动 子和第一个结构基因之间,引起转录的部分终止的序列区段

C_region 免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和T-细胞受体α,β,和γ链;根据特定的链可包括 一个或多个外显子

CAAT_signCAAT盒;位于可能参与RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bpal 上游的保守序列的一部分;共有序列=GG(C或T)CAATCT CDS 编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子);

特征包括氨基酸概念上的翻译

Conflict 在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同 D-loop

置换环;线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配

对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域

D-segment 免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链

Enhancer 顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启

动子相关的任何位置处 (上游或下游)起作用

Exon 编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5'UTR,所有CDS,和3'UTR GC_signal GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷 贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGG gene 鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称 iDNA intron

间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA

被转录的DNA区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内

部将其除去

J_segment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链 LTR

长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒中

mat_peptide 成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物

的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的CDS不同)

misc_bindin不能用任何其它Binding关键词(primer_bind或protein_bind)表述的与另一个组g 成成分共价或非-共价结合的核酸中的位点

misc_differ特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词ence (conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)

表述

misc_featur不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征e

misc_recom任何一般性的,位点特异性的或复制的重组事件的位点,该位点中有不能用其它b 重组关键词(iDNA和virion)或来源关键词的修饰词(/transposon,/proviral)表述的

双螺旋DNA的断裂和愈合

misc_RNA 不能用其他RNA关键词

(prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,CDS, sig_peptide,transit__ __peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,

rRNA,tRNA,scRNA和snRNA)限定的任何转录本或RNA产物

misc_signal 含有控制或改变基因功能或表达之信号的任何区域,所述信号不能用其他Signal

关键词

(promoter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,polyA_signal,enhancer,attenuator,terminator,和rep_origin)表述

misc_struct不能用其他Structure关键词(stem_loop和D-loop)表述的任何二级或三级结构或ure 构象

modified_b被指示的核苷酸是经修饰的核苷酸,并应由被指示的分子(在mod_base修饰词意ase 义中给出)所取代 mRNA 信使RNA;包括5'非翻译区(5'UTR),编码序列(CDS,外显子)和3'非翻译区(3

'UTR)

mutation 在此位置处,相关品系的序列中具有突然的,可遗传的变化 N_region Old_sequence

PolyA_signal

PolyA_site

在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸 在此位置处,所表述的序列修改了此序列以前的版本

聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解RNA转录本所必需的识别区域;共有序列=AATAAA

RNA转录本上的位点,通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基

Precursor_仍不是成熟的RNA产物的任何RNA种类;可包括5'剪切区(5'clip),5'非翻译区RNA (5'UTR),编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子),3'非翻译区(3'UTR),

和3'剪切区(3'clip)

prim_transc初级(最初的,未加工的)转录本;包括5'剪切区(5'clip),5'非翻译区(5ript 'UTR),编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子),3'非翻译区(3'UTR)和3'剪切区

(3'clip)

prim_bind 起始复制,转录或逆转录的非-共价的引物结合位点;包括合成的例如PCR引物

元件的位点

Promoter 参与RNA聚合酶的结合以启动转录的DNA分子区域 protein_bin核酸上非-共价的蛋白质结合位点 d RBS 核糖体结合位点 repeat_regi含有重复单位的基因组区域 on

repeat_unit 单个重复元件

rep_origin 复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点 RRNA S_region Satellite

成熟的核糖体RNA;将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份

免疫球蛋白重链的开关区;它参与重链DNA的重排,导致来自相同B-细胞的不同免疫球蛋白类的表达

短的基本重复单位的很多串联重复(相同或相关的);大多数具有的碱基组成或其它性质与基因组的一般水平不同,这使得它们与大部分(主带)的基因组DNA分离开来

小的细胞质RNA;几个小的细胞质RNA分子中的任何一个存在于真核生物的细胞质和(有时)核中

ScRNA

sig_peptide 信号肽编码序列;被分泌的蛋白质的N-末端结构域的编码序列;此结构域涉

及新生多肽与膜的结合;前导序列

SnRNA 小的核RNA;很多小的RNA种类中的任何一个都被局限于核中;几个snRNA

参与剪接或其它RNA加工反应

source 鉴定序列中特定范围的生物来源;此关键词是强制性的;每一项至少要有一个

跨越整个序列的单一来源关键词;每个序列可允许有一个以上的来源关键词

stem_loop 发卡结构;由RNA或DNA单链的相邻(反向)互补序列之间的碱基一配对形

成的双螺旋区域

STS 序列标记位点:表述基因组上作图界标并能通过PCR检测的短的,单拷贝DNA

序列;通过测定STS系列的次序即可作出图谱的基因组区域

TATA_signTATA盒;Goldberg-Hogness盒;在每个真核生物RNA聚合酶Ⅱ转录单位起点al 前约25bp处发现的保守的富含AT的七聚体,它可能涉及使酶定位以正确地起

始;共有序列=TATA(A或T)A(A或T)

terminator 或者位于转录本的末端或者与启动子区域相邻的DNA序列,该序列可导致RNA

聚合酶终止转录;也可以是阻抑蛋白的结合位点

transit_pept转运肽编码序列;核编码的细胞器蛋白质N-末端结构域的编码序列;此结构ide 域参与将蛋白质翻译后运送到细胞器中 tRNA 成熟的转移RNA,,小的RNA分子(75-85个碱基长),介导核酸序列翻译成

氨基酸序列

unsure 作者不能确定此区域的准确序列

V_region 免疫球蛋白轻链和重链的可变区,和T-细胞受体α,β和γ链;编码可变的氨

基末端部分;可由V_segment,D_segment,N_region和J_segment组成

V_segment 免疫球蛋白轻链和重链的可变区段,和T -细胞受体α,β和γ链;编码大多数

可变区(v_region)和前导肽的最后几个氨基酸 variation 3’clip 3’UTP 5’clip 5’UTP

含有来自相同基因的稳定突变的相关系列(例如RFLP,多态性等),在此(和可能其它)位置处所述相同基因与被表述的不同 在加工过程中被切下的前体转录本3'端大部分区域

不被翻译成蛋白质的成熟转录本的3'末端区域(终止密码子之后) 在加工过程中被切下的前体转录本5'端大部分区域

不被翻译成蛋白质的成熟转录本的5'末端区域(起始密码子之前)

_ 10 _signal Pribnow盒;细菌转录单位起点上游约10bp处的保守区域,它可能参与结合RNA

聚合酶;共有序列=TatAaT _ 35 _signal 细菌转录单位起点上游约35bp处的保守六聚体;共有序列=TTGACa[]或

TGTTGACA[]

与蛋白质序列相关的特征关键词表 关键词 CONFLICT VARIANT

说明

不同的论文报道了不同的序列 作者报道存在序列变体

VARSLIC MUTAGEN MOD_RES ACETYLATION AMIDATION BLOCKED FORMYLATION GAMMA-CARBOXY- GLUTAMIC ACID HYDROXYLATION METHYLATION PHOSPHORYLATION PYRROLIDONE CARBOXYLICACID SULFATATION LIPID MYRISTATE PALMITATE FARNESYL

由可选择的剪接产生的序列变体的表述 经实验操作已改变的位点 残基的翻译后修饰 N-末端或其它

通常位于成熟的活性肽的C-末端 不能被测定的N-或C-末端封闭基团 N-末端甲硫氨酸的

天冬酰胺,天冬氨酸,脯氨酸或赖氨酸的 通常为赖氨酸或精氨酸的

丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸,天冬氨酸或组氨酸的 已形成内部环内酰胺的N-末端谷氨酸 通常为酪氨酸的 脂质组成成分的共价结合

通过酰胺键与蛋白质成熟形式的N-末端甘氨酸残基或内部的赖氨酸残基结合的豆蔻酸基团

通过硫酯键与半胱氨酸残基或通过酯键与丝氨酸或苏氨酸残基结合的棕榈酸基团

通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的法尼基

GERANYL-GERANYL 通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的香叶基-香叶基基团 GPI_ANCHOR N_ACYL

DIGLYCERIDE DISULFID THIOLEST THIOETH CARBOHYD METAL BINDING SIGNAL TRANSIT PROPEP

与蛋白质成熟形式C-末端残基的α-羧基相连的糖基-磷脂酰肌醇(GPI)基团

原核生物脂蛋白成熟形式的N-末端半胱氨酸,所述脂蛋白具有酰胺-键联的脂肪酸和通过酯键连接了两个脂肪酸的甘油基 二硫键;“FROM”和“TO”终点表示通过一个链-内二硫键连接的两个残基;如果“FROM”和“TO”终点是完全相同的,则二硫键是链-间键,而说明书领域示出交联的性质

硫醇酯键;“FROM”和“TO”终点表示通过硫醇酯键连接的两个残基硫醚键;“FROM”和“TO”终点表示通过硫醚键连接的两个残基 糖基化位点;碳水化物(如果已知)的性质在说明书领域给出 金属离子的结合位点;说明书领域示出金属的性质

任何化学基团(辅酶,辅基,等等)的结合位点;基团的化学性质在说明书领域给出 信号序列的范围(前肽)

运转肽的范围(线粒体,叶绿体或微体) 前肽的范围

CHAIN PEPTIDE DOMAIN CA_BIND

成熟蛋白质中多肽链的范围 被释放的活性肽的范围

序列中感兴趣的区域的范围;所述区域的特征在说明书领域给出钙-结合区域的范围

DNA_BIND DNA--结合区域的范围 NP_BIND TRANSMEM ZN_FING SIMILAR REPEAT HELIX STRAND TURN ACT_SITE SITE INIT_MET

核苷酸磷酸酯结合区域;核苷酸磷酸酯的特征示于说明书领域 转膜区域的范围 锌指区域的范围

与另一个蛋白质序列具有相似性的区域;与那个序列有关的精确的资料在说明书领域给出 内部序列重复的范围

二级结构;螺旋,例如α-螺旋,3(10)螺旋,或Pi-螺旋 二级结构;β-链,例如氢键连接的β-链,或分离的β-桥中的残基

二级结构转角,例如H-键连的转角(3-转角,4-转角或5-转角)

涉及酶活性的氨基酸 序列中任何其它感兴趣的位点 已知序列以起始密码子甲硫氨酸开始

序列末端的残基不是末端残基;如果应用于位置1,这表示第一个位置不是完整分子的N-末端;如果应用于最后一个位置,这表示此位置不是完整分子的C-末端;对此关键词没有说明书领域

非连串残基;表示序列中的两个残基不是连串的,在它们之间有很多末测序的残基

序列的不确定性;用于表述不能确定序列排列的序列区域

NON_TER

NON_CONS UNSURE

范文九:氨基酸密码子表 投稿:高炒炓

表14-3氨基酸缩写符号

缩写 Ala Cys Asp Glu Phe Gly His Ile Lys Leu 氨基酸

alamine cysteine

aspartic acid glutamic acid Phenylalanine glycine Histidine Isoleucine lysine leucine

丙氨酸 半胱氨酸 天冬氨酸 谷氨酸 苯丙氨酸 甘氨酸 组氨酸 异亮氨酸 赖氨酸 亮氨酸

缩写 Met Asn Pro Gln Arg Ser Thr Val Trp Tyr

M N P Q R S T V W Y

氨基酸

methionine asparagine proline glutamine arginine serine threonine valine

tryptophan tyrosine

甲硫氨酸 天冬酰胺 脯氨酸 谷氨酰胺 精氨酸 丝氨酸 苏氨酸 纈氨酸 色氨酸 酪氨酸

A C D E F G H I K L

范文十:氨基酸及其密码子对照 投稿:马穐穑

氨基酸及其密码子对照

Alanine Arginine

Ala Arg

A R

GCU, GCC, GCA, GCG CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG

AAU, AAC GAU, GAC UGU, UGC CAA, CAG GAA, GAG GGU, GGC, GGA, GGG

CAU, CAC AUU, AUC, AUA

Aspartic acid

Asp

D

Glutamic acid Glycine

Glu Gly

E G

UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG Proline Serine Threonine

Pro Ser Thr

P S T

AAA, AAG AUG UUU, UUC CCU, CCC, CCA, CCG UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,AGC

ACU, ACC, ACA, ACG

UGG UAU, UAC GUU, GUC, GUA, GUG

AUG *

Valine

Val

V

Stop

UAG (amber), UGA (opal), UAA (ochre)

AUG is the most common start codon. Alternative start codons include CUG in eukaryotes and GUG in prokaryotes.

常用限制性酶及其酶切位点

AatII AflII AgeI ApaI ApaLI AseI BamHI BclI BglII BstBI ClaI DraI EagI EcoRI EcoRV FspI HindIII HpaI

GACGT C C TTAAG A CCGGT GGGCC C G TGCAC AT TAAT G GATCC T GATCA A GATCT TT CGAA AT CGAT TTT AAA C GGCCG G AATTC GAT ATC TGC GCA A AGCTT GTT AAC

KpnI NarI NcoI NdeI NheI NotI NruI PmlI PstI PvuII SacI SacII SalI SmaI SpeI StuI XbaI XhoI

GGTAC C GG CGCC C CATGG CA TATG G CTAGC GC GGCCGC TCG CGA CAC GTG CTGCA G CAG CTG GAGCT C CCGCG G G TCGAC CCC GGG A CTAGT AGG CCT T CTAGA C TCGAG

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